如何將分子根據特定的鍵做旋轉??

xroxzero · 发表于 Post on 2017-4-7 10:49:00

各位老師好

最近我再建構模型時想要對分子做旋轉，就是將幾個殘基對一個特定的化學鍵做旋轉，VMD裡有方法可以將分子對特定向量做旋轉嗎?

謝謝各位老師~

liyuanhe211 · 发表于 Post on 2017-4-7 11:53:06

是分子整体旋转？还是键两边的基团相对的旋转

ggdh · 发表于 Post on 2017-4-7 15:34:54

本帖最后由 ggdh 于 2017-4-7 15:37 编辑

ms里面选中这跟键。然后在3D Viewer工具栏中点view across工具让这根键垂直于屏幕，然后选中你要旋转的片段，在3D Movement 工具栏中打开movement 面板，输入一次旋转的角度。点move around z 按钮旋转即可

xroxzero · 发表于 Post on 2017-4-7 15:39:16

liyuanhe211老師

是键两边的基团相对的旋转喔

sobereva · 发表于 Post on 2017-4-7 18:04:11

直接在gview里用二面角工具来旋转就行了，最省事。
如果非要用VMD，也有办法做到，涉及到利用旋转矩阵，得敲不少命令，麻烦一些

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[VMD] 如何將分子根據特定的鍵做旋轉??

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