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[Gaussian/gview] 自由基材料的振动光谱计算出现报错

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在linux系统中计算FC 光谱,第一步正常计算完成,但在第二步计算基态结构优化并联系激发态分子时系统出现如下报错:
Scratch directory /home/tmp/wsx/1967.master created.
Using /home/tmp/wsx/1967.master for temporary Gaussian 16.C02 files.
Starting Gaussian run at 2025年 10月 09日 星期四 08:17:44 CST
Error: segmentation violation
   rax 0x0000000000000000, rbx 0x00000000015044b0, rcx 0xffffffffffffffff
   rdx 0x000000000003bc95, rsp 0x00007ffda574f898, rbp 0x00000000014ff860
   rsi 0x000000000000000b, rdi 0x000000000003bc95, r8  0x00000000014e9a10
   r9  0x0000000065884570, r10 0x00007ffda574eca0, r11 0x0000000000000202
   r12 0x00000000014ff8e0, r13 0x00007ffda574fdd0, r14 0x0000000000000025
   r15 0x00000000015032e0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x7ffb23202630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x7ffb22b59657]
Error: segmentation violation
   rax 0x0000000000000000, rbx 0x00000000015044b0, rcx 0xffffffffffffffff
   rdx 0x000000000003f671, rsp 0x00007ffc5c57f418, rbp 0x00000000014ff860
   rsi 0x000000000000000b, rdi 0x000000000003f671, r8  0x00000000014e9a10
   r9  0x0000000064eca570, r10 0x00007ffc5c57e820, r11 0x0000000000000206
   r12 0x00000000014ff8e0, r13 0x00007ffc5c57f950, r14 0x0000000000000025
   r15 0x00000000015032e0
  /lib64/libpthread.so.0(+0xf630) [0x7f3e005b9630]
  /lib64/libc.so.6(kill+0x7) [0x7f3dfff10657]

real        11m24.398s
user        821m6.968s
sys        22m42.713s
Finished Gaussian run at 2025年 10月 09日 星期四 08:40:35 CST
Work Dir is : /home/wsx/data/250927-state=2/jixiaodian/TTM
SCRDIR is: /home/tmp/wsx/1967.master
out文件报错如下:


202510090939387014..png (77.2 KB, 下载次数 Times of downloads: 0)

202510090939387014..png

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发表于 Post on 2025-10-9 14:17:56 | 只看该作者 Only view this author
你都没写geom=connectivity,又在坐标后面出现了连接关系而且又要从输入文件末尾读取信息,当然导致读取错误。从提示明显看到把连接关系当成文件名读取了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-10-9 16:28:31 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2025-10-9 14:17
你都没写geom=connectivity,又在坐标后面出现了连接关系而且又要从输入文件末尾读取信息,当然导致读取错 ...

好的,谢谢sober老师

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发表于 Post on 2025-10-10 10:28:10 | 只看该作者 Only view this author
如果待算分子是自由基,注意自旋污染问题。如果激发态自旋污染严重,高斯计算结果是不能发表的,必须用BDF等软件做自旋匹配TDDFT计算。参见https://mp.weixin.qq.com/s/1qA_QZRzYZxN6MVJw44Wfg
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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