vmd无法加载IGMH的cub文件求助

科研小白0126 · 发表于 Post on 2025-11-11 15:50:24

各位老师，我在进行IGMH计算时，我的分子原子总数在500左右，格点我用的0.15,0.15.,015，算完文件较大，用source IGM_inter.vmd命令时，vmd出现这种情况，这是我内存问题吗，希望有老师能给予指导，万分感谢

pal · 发表于 Post on 2025-11-11 16:14:47

大概是内存爆了

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2025-11-11 16:30:24

内存不够，VMD到2GB就不行了。可以考虑换64位版本。站内搜索VMD  64有一些帖子，比如这个
原生Windows平台vmd1.9.3 x64版本 - 资源分享 - 计算化学公社  http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ;highlight=VMD%2B64
Windows版本vmd1.9.4 cuda x64测试版 - 资源分享 - 计算化学公社  http://bbs.keinsci.com/forum.php ... ;highlight=VMD%2B64

科研小白0126 · 发表于 Post on 2025-11-11 17:07:47

SharkYYX2025 发表于 2025-11-11 16:30
内存不够，VMD到2GB就不行了。可以考虑换64位版本。站内搜索VMD 64有一些帖子，比如这个
原生Windows平台 ...

好的感谢老师，降低精度（格点）是不是也可以算一种方法

SharkYYX2025 · 发表于 Post on 2025-11-11 23:18:19

本帖最后由 SharkYYX2025 于 2025-11-11 23:23 编辑

科研小白0126 发表于 2025-11-11 17:07
好的感谢老师，降低精度（格点）是不是也可以算一种方法

我觉得可以试试。但是这样有可能等值面不太清晰，比较毛糙不美观。不影响观看是可以接受的，在你目标区域反映出相互作用的大概位点，然后边缘细节可能看不清。下文的10有介绍
谈谈与计算化学有关的作图的图像清晰问题 - 思想家公社的门口：量子化学·分子模拟·二次元 http://sobereva.com/607

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