计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 187|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 关于使用CP2K进行硅表面悬键键能计算的求助

[复制链接 Copy URL]

13

帖子

0

威望

271

eV
积分
284

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
各位老师好,我最近需要计算Si表面悬键Si-H键、Si-OH、Si-F、Si-Cl、Si-Br的键能,但得到的结论与文献或平常认知的不同,比如计算得到的Si-H键键能大于Si-OH的键能,Si-Cl、Si-Br的键能小于计算得到的Si-OH的键能,这令我十分困惑。所以想求助各位老师,辛苦帮我看一下是哪里出现了问题。我以计算的Si-H键为例,将计算的过程详细列在了下面。

(1)结构优化。我根据文献所述,以每个硅原子带一个氢的表面进行结构优化(即表面重构),具体的输入文件以附件形式上传,名字为Si_H_opt_chonggou.inp,计算得到的.restart与.out文件也一并上传;并用同样基组、k点和周期性下计算了这个体系的能量,具体的输入文件和输出文件也一并以附件形式上传,名字为Si_H_opt_chonggou_energy.inp/out。
(2)删掉一个氢原子后的能量计算。接下来我将硅表面的一个氢原子删掉,计算剩下的体系的能量,k点与周期性的设置与结构优化的条件是一致的,其中体系电荷设置如下:CHARGE   0 #Net charge     MULTIPLICITY    2 #Spin multiplicity  UKS。具体的输入文件和输出文件也一并以附件形式上传,名字为Si_H_opt_chonggou_deleted_H.inp/out
(3)计算氢原子的能量。最后我将第(2)步中被删掉的氢原子留下,计算H的能量,不设置k点与周期性,体系的电荷设置如下:CHARGE 0 #Net charge    MULTIPLICITY   2 #Spin multiplicity UKS。具体的输入文件和输出文件也一并以附件形式上传,名字为H_ENERGY.inp/out
(4)键能计算公式。最后键能照样按E(AB)-E(A)-E(B)得到。
上述就是我计算硅表面键能的详细方法,还请大家帮忙看一下哪里有误,这个过程应该怎样是合理准确的。万分感谢!!!



H_ENERGY.inp

2.18 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

氢能量计算的输入文件

H_ENERGY.out

25.35 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

氢能量计算的输出文件

Si_H_opt_chonggou.inp

7.32 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

结构优化后的能量计算的输入文件

Si_H_opt_chonggou.out

141.17 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

结构优化后的能量计算的输出文件

Si_H_opt_chonggou_deleted_H.inp

5.83 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

删掉一个氢原子来计算能量的输入文件

Si_H_opt_chonggou_deleted_H.out

26.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

删掉一个氢原子来计算能量的输出文件

Si_H_opt_chonggou_energy.inp

6 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

结构优化的输入文件

Si_H_opt_chonggou_energy.out

25.49 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

结构优化输出文件

Si_H_opt_chonggou-1.restart

9.09 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

结构优化的restart文件

13

帖子

0

威望

271

eV
积分
284

Level 3 能力者

2#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-11-16 17:37:55 | 只看该作者 Only view this author
还请各位可能知道什么原因的老师停步来帮助指导一下哦,至今还是没有解决这个问题

23

帖子

0

威望

225

eV
积分
248

Level 3 能力者

3#
发表于 Post on 2026-1-5 10:11:36 | 只看该作者 Only view this author
楼主请问这个问题解决了吗

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-1-23 20:06 , Processed in 0.173748 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list