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[其它] 将.fchk转为.molden用IBOview打开报错

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楼主
LoadOrbitalFile failed: *ERROR while loading file 'C:/Users/Administrator/Desktop/IRC-TS-INT3-NL-5.molden':Unexpected format: 'expected '[Molden Format]'
请问该问题如何解决,是否一定需要用ORCA?

202312291118039769..png (13.7 KB, 下载次数 Times of downloads: 74)

202312291118039769..png

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发表于 Post on 2025-4-25 16:08:56 | 只看该作者 Only view this author
如图所示

202504251607443099..png (272.85 KB, 下载次数 Times of downloads: 58)

202504251607443099..png

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发表于 Post on 2025-12-12 02:27:40 | 只看该作者 Only view this author

试过了,不行的

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发表于 Post on 2025-12-12 02:35:36 | 只看该作者 Only view this author
zhdeng 发表于 2025-12-12 02:27
试过了,不行的

2L的做法完全不对,网页里胡写
Gaussian根本没法直接产生molden文件


用Multiwfn载入fchk等任意其支持的波函数文件,主功能100的子功能2导出molden文件,根本不需要任何折腾。这是最简单方法,没有之一

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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发表于 Post on 2025-12-12 20:17:29 | 只看该作者 Only view this author
IBOview读取的molden文件必须是unix换行符。用dos2unix、ultraedit等工具转化一下就可以了

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2025-12-12 21:16:55 | 只看该作者 Only view this author
beefly 发表于 2025-12-12 20:17
IBOview读取的molden文件必须是unix换行符。用dos2unix、ultraedit等工具转化一下就可以了

好的
谢谢您

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发表于 Post on 2025-12-12 21:58:16 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 Uus/pMeC6H4-/キ 于 2025-12-13 00:16 编辑

补充几个细节:
1. 至今Gaussian的程序设计就确实没有把波函数信息按molden文件格式输出的功能;
2. IboView网页Picture Guide To IboView中最后一点"See also: {link} for additional comments on getting .molden files from Gaussian."链接的原始网页已无法访问,网页时光机找到的存档开头是这么写的:
Using Molden with GAUSSIAN
* When using Molden with GAUSSIAN 94/98/03 the following keywords are required on the GAUSSIAN 94/98/03 inputfile:
    #P GFINPUT IOP(6/7=3)
#P switches on printing of SCF convergence, GFINPUT switches on printing of Basis Set info, and IOP(6/7=3) switches on printing of all MO's.

注意Molden虽然现在常指代一种波函数信息的文件格式,但原先是指定义该文件格式的一个上古可视化软件。我估计Molden软件可以加载写了这些关键词的Gaussian输出文件并读到波函数信息,这也是Using Molden with GAUSSIAN页面原作者解释的Molden软件与Gaussian联用的做法;然而IBOview的作者理解出了偏差,误以为这些关键词能从Gaussian导出molden文件。
3. 截至目前的v20211019-RevA版本,可以验证IboView并不能加载Gaussian输出文件,更无法从中读取波函数信息。
4. 抽象的IOp(6/7=3)实际上就是关键词pop=full,要求打印所有分子轨道的展开系数及密度矩阵,结合gfinput要求打印的基组定义确实可以让Gaussian输出文件像ORCA和GAMESS-US输出文件那样带着波函数信息,代价当然是让输出文件冗长而庞大,而且现在没有什么刚需的可视化软件会从Gaussian输出文件读波函数信息。
5. orca_2mkl输出的molden文件不是标准格式,但是Multiwfn、IboView、一代Avogadro等若干软件都有特定处理机制使得波函数信息正确读取,这点在ORCA论坛讨论过(https://orcaforum.kofo.mpg.de/viewtopic.php?f=8&t=11599);而社长的multiwfn,以及5楼老师的Molden2AIM,转换出的molden文件应该是标准的。
√546=23.36664289109

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