“第10届量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班将于5月4-8日于北京举办,这是一次性完整、系统学习波函数分析的各种理论知识和全面掌握强大的Multiwfn波函数分析程序使用的最不可错过的机会!请点击此链接查看详情和报名方式,欢迎参加!

“第18届北京科音分子动力学与GROMACS培训班” 将于5月23-26日于北京举办。这是一次性全面、系统学习分子动力学模拟知识和最流行的分子动力学程序GROMACS的关键机会!报名正在进行中,请点击此链接查看详情,欢迎参加!

计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 155|回复 Reply: 8
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[CP2K] 请问关于OOH在Pt111面上吸附的理论方法选择

[复制链接 Copy URL]

20

帖子

0

威望

175

eV
积分
195

Level 3 能力者

我使用PBED4组合对OOH在Pt111面上的吸附结构进行几何优化,得到的构型是接近平躺的结构,但很多文献例如Nørskov 他们得到是明显立起来的top位点,用的是RPBE且那时还没有色散修正,而RPBE几乎不能描述弱相互作用,那这样的结构还可信吗?另外sob老师也说过DFT-D系列色散修正免费用着又方便,且有益无害,所以对于此类ORR物种的优化计算该选择什么理论方法组合?

148

帖子

0

威望

1440

eV
积分
1588

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
大概率是你输入文件没处理好。一般是站着的

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
126269

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 前天 08:00 | 只看该作者 Only view this author
不要24小时内在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛里问同一问题,注意看群规(http://sobereva.com/QQrule.html),以及论坛置顶的论坛新社员必读贴
群里回复过了

【社长】Sobereva@北京科音(190258442) 2026/4/18 19:21:59
先弄清楚文献的是否合理

【社长】Sobereva@北京科音(190258442) 2026/4/18 19:22:18
如果没有绝对的可信度,没法拿来说事
很多老文章算的结果都是错的

【社长】Sobereva@北京科音(190258442) 2026/4/18 19:31:40
至少没法说带了D4有问题,反倒很可能说明前人的结果可能有问题
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

20

帖子

0

威望

175

eV
积分
195

Level 3 能力者

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 10:59 | 只看该作者 Only view this author
跟别人讨论了下,OOH在干净的Pt表面上的优势吸附构型就是桥位,Norskov他们当年也用了显式水

3815

帖子

3

威望

1万

eV
积分
20537

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

5#
发表于 Post on 前天 14:41 | 只看该作者 Only view this author
那你测试过D4之外的修正或者别的方式来描述色散的方法么?我个人经验是
1、我之前做了个LDH的层状结构,结果D4和D3有显著差别;
2、部分文献有数据,其实对于金属表面吸附色散修正未必真的无害,你可以找找相关的文献看看。
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

20

帖子

0

威望

175

eV
积分
195

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 17:17 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2026-4-19 14:41
那你测试过D4之外的修正或者别的方式来描述色散的方法么?我个人经验是
1、我之前做了个LDH的层状结构,结 ...

我试过d3跟d4优化出的构型都是桥位

3815

帖子

3

威望

1万

eV
积分
20537

Level 6 (一方通行)

围观吃瓜群众

7#
发表于 Post on 前天 21:29 | 只看该作者 Only view this author
kogareru1z 发表于 2026-4-19 10:59
跟别人讨论了下,OOH在干净的Pt表面上的优势吸附构型就是桥位,Norskov他们当年也用了显式水

那么你的结果是否考虑了显式溶剂?
日常打哑谜&&探寻更多可能。
原理问题不公开讨论,非商业性质讨论欢迎私聊。不做培*,不接代*,不接*发谢谢。

20

帖子

0

威望

175

eV
积分
195

Level 3 能力者

8#
 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 11:06 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2026-4-19 21:29
那么你的结果是否考虑了显式溶剂?

真空优化是桥位,加了两层显式水后能稳住top位

20

帖子

0

威望

175

eV
积分
195

Level 3 能力者

9#
 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 23:02 | 只看该作者 Only view this author
卡开发发 发表于 2026-4-19 14:41
那你测试过D4之外的修正或者别的方式来描述色散的方法么?我个人经验是
1、我之前做了个LDH的层状结构,结 ...

能推荐几篇金属表面吸附色散修正的相关的论文吗?

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-4-21 00:13 , Processed in 0.235825 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list