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[CP2K] 求助:CP2K使用HLE17泛函计算苯分子吸附体系的能带的若干问题与审稿意见

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本帖最后由 HydroKagami 于 2026-5-27 11:56 编辑

老师们好,我使用CP2K在HLE17泛函下计算了某个碳基Fe单原子体系的slab以及其吸附若干有机气体分子的能带。
用Multiwfn解析BAND.bs,slab材料本身的gap为0.009eV,对HCHO、丙酮、苯分子吸附的gap为0.192、0.362、0.392eV。
但是根据吸附能数据,苯分子的吸附能是最差的,并且不同于含氧的分子有明确的结合位点产生化学吸附。
我同时计算了原子电荷(Hirshfeld电荷)显示苯分子的电荷转移量只有0.059e,远小于另外两种有机分子,又通过IGMH分析发现苯分子的确主要以弱相互作用的形式吸附在slab上。
有3个审稿人对这个反常gap打开的机制产生了疑问,并且基于另一个审稿人要求的对PBE泛函计算的测试,我发现PBE计算苯分子吸附体系的能带,其gap只有0.007eV,和PBE计算的纯slab的gap几乎一致,而另外两种有机气体在PBE计算下的带隙仍保持同一趋势。
我本来试图说明是苯分子吸附诱导的slab形变导致的带隙打开,我又补充计算了HLE17下,对苯分子吸附后体系删去苯分子,只对因苯分子吸附导致了形变的slab计算能带,但是这个结果显示gap为0.009eV,也不能说明我的猜想。
我现在还做了对Fe和苯的PDOS和OPDOS分析(HLE17泛函下结合对角化给出的molden),显示Fe的PDOS和苯的PDOS几乎没有重叠,但HOCO的等值面在苯上,LUCO的等值面在slab上。请问我应该如何说明这个带隙打开的机制?还是说HLE17的计算在这个体系中出现了问题,把苯的gap也纳入了?

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发表于 Post on 3 day ago | 只看该作者 Only view this author
先明确是否只有HLE17才能算出来苯导致体系gap的显著变化,而PBE则不能。如果是这样,再看看r2SCAN、TPSS等其他泛函是什么情况。若能对基底扩胞后用HSE06算一下带隙变化更好,更有说服力。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 前天 22:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-28 02:13
先明确是否只有HLE17才能算出来苯导致体系gap的显著变化,而PBE则不能。如果是这样,再看看r2SCAN、TPSS等 ...

老师好,在同样基组、K点设置下,r2SCAN、TPSS下计算的带隙分别为0.004553、0.006487eV,和PBE的几乎一致。扩胞算HSE06会爆内存,我用OpenMP并行用psmp在尝试

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 楼主 Author| 发表于 Post on yesterday 22:47 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-28 02:13
先明确是否只有HLE17才能算出来苯导致体系gap的显著变化,而PBE则不能。如果是这样,再看看r2SCAN、TPSS等 ...

HSE06算出来的gap是0.477060 eV,和HLE17的趋势一致

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发表于 Post on 11 hour ago | 只看该作者 Only view this author
HydroKagami 发表于 2026-5-30 22:47
HSE06算出来的gap是0.477060 eV,和HLE17的趋势一致

如果鲁棒、认可度高的HSE06能支撑之前的结果,就这么回答审稿人就行了
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 楼主 Author| 发表于 Post on 1 hour ago | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2026-5-31 02:43
如果鲁棒、认可度高的HSE06能支撑之前的结果,就这么回答审稿人就行了

感谢老师的回复。两个审稿人的原话分别是:
# Inconsistency Between Charge Transfer and Band Gap Trends
A key conceptual issue:
• Benzene shows the largest band gap opening but negligible charge transfer.
• Oxygenated VOCs show stronger charge transfer but smaller gap changes.
This apparent contradiction is not sufficiently explained and requires deeper orbital-level analysis.

#According to the results, benzene has medium interaction energy (-0.5 eV), but low charge transfer. However, the authors assume that the hybridization or orbitals in the valence band between benzene and Fe-doped graphyne is not significant, even when breaking the symmetry of the material similarly to other adsorbates. My question is: why have they assumed that the hybridization is not significant? The valence band shows peaks from the adsorbate and substrate that overlap, which indicates otherwise.

请问我现在的补充计算证据和COOP是否足以回复?还有其他更好的证据吗?

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