zmatrix 与xyz坐标转换问题

nuke

linux下的高斯。 我需要将xyz坐标的输入文件转化为 zmatrix的形式 请问如何做呀？最好使用命令格式，newzmat可以实现么？ 具体命令可否告知一下 谢谢！
我输入 newzmat  h2o.gjf -ozmat h2o-zmat.gjf
得不到下面的h2o-zmat.gjf 的形式



输入文件为 h2o.gjf
%mem=200MB
%nproc=4
# b3lyp/6-311++g**

Title Card Required

0 1
O  0    4.54118984800000        8.25839353400000       -2.12332226800000      
H  0    4.05796480178833        8.36400127410889       -2.63183021545410      
H  0    5.35649972500000        7.83714888500000       -2.52059140100000      

h2o-zmat.gjf 的形式
%mem=200MB
%nprocshared=4
# b3lyp/6-311++g(d,p)

Title Card Required

0 1
O
H                  1            B1
H                  1            B2    2            A1

   B1             0.70939395
   B2             1.00000000
   A1           109.46999445

itpfeng

少问这种自己花点时间就可以得到答案的问题，既然知道newzmat，那么查一下newzmat的用法或者manual不就知道了
看看它支持什么什么文件格式，语法是什么样的。
newzmat  -iformat -oformat input_file_name output_file_name

PS：正常gaussian输入文件格式是cart

nuke

itpfeng 发表于 2017-8-14 01:40
少问这种自己花点时间就可以得到答案的问题，既然知道newzmat，那么查一下newzmat的用法或者manual不就知道 ...

。。。 我不是说了么 那样得不到h2o-zmat.gjf
newzmat -ixyz -ozmat h2o.gjf h2o-zmat.gjf
您可以得到么？

itpfeng

nuke 发表于 2017-8-14 12:00
。。。 我不是说了么 那样得不到h2o-zmat.gjf
newzmat -ixyz -ozmat h2o.gjf h2o-zmat.gjf
您可以得到 ...

有些无语。你试过 -icart 了？按manual上说 -ixyz 是转换  .xyz 文件的。