计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10196|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 计算Solvent效应报错"No solvent atoms in DisRep"

[复制链接 Copy URL]

24

帖子

0

威望

156

eV
积分
180

Level 3 能力者

用CPCM模型,加入dispersion, repulsion correction时出错。
请教该如何解决,是缺了参数吗?已经设定了数据库中有的solvent为什么还提示"No solvent atom in DisRep"。
谢谢各位老师~

输入文件如下:
# opt() freq m062x/6-311G(2df,p) SCRF(CPCM, solvent=AceticAcid,read)

Title Card Required

0 1
O                  0.00000000    0.00000000    0.11813800
H                  0.00000000    0.75681000   -0.47255200
H                  0.00000000   -0.75681000   -0.47255200

dis
rep
cav

输出文件最后一段:
------------------------------------------------------------------------------
Polarizable Continuum Model (PCM)
=================================
Model                : C-PCM.
Atomic radii         : UFF (Universal Force Field).
Polarization charges : Total charges.
Charge compensation  : None.
Solution method      : On-the-fly selection.
Cavity type          : Scaled VdW (van der Waals Surface) (Alpha=1.100).
Cavity algorithm     : GePol (No added spheres)
                        Default sphere list used, NSphG=    3.
                        Lebedev-Laikov grids with approx.  5.0 points / Ang**2.
                        Smoothing algorithm: Karplus/York (Gamma=1.0000).
                        Polarization charges: spherical gaussians, with
                                              point-specific exponents (IZeta= 3).
                        Self-potential: point-specific (ISelfS= 7).
                        Self-field    : sphere-specific E.n sum rule (ISelfD= 2).
1st derivatives      : Analytical E(r).r(x)/FMM algorithm (CHGder, D1EAlg=3).
                        Cavity 1st derivative terms included.
Solvent              : AceticAcid, Eps=   6.252800 Eps(inf)=   1.882384
------------------------------------------------------------------------------
Spheres list:
ISph  on   Nord     Re0    Alpha      Xe            Ye            Ze
    1   O      1    1.7500  1.100      0.000000      0.000000      0.118138
    2   H      2    1.4430  1.100      0.000000      0.756810     -0.472552
    3   H      3    1.4430  1.100      0.000000     -0.756810     -0.472552
------------------------------------------------------------------------------
Warning! Inconsistent VMol and RSolv for this solvent, using VMol=    0.00 Ang**3.
No solvent atoms in DisRep.
Error termination via Lnk1e in /opt/shared/Gaussian/g09.d01/g09/l301.exe at Sat Sep  2 18:35:29 2017.


357

帖子

0

威望

2071

eV
积分
2428

Level 5 (御坂)

真 掘墓者

2#
发表于 Post on 2017-9-6 01:45:04 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 kyuu 于 2017-9-6 02:49 编辑

把后边的
Dis
Rep
Cav
去掉才让算
非要算非极性作用啊
圣诞刨坟忙

24

帖子

0

威望

156

eV
积分
180

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-6 04:01:33 | 只看该作者 Only view this author
kyuu 发表于 2017-9-6 01:45
把后边的
Dis
Rep

算过不加参数的了,老板想要看看加了非极性作用会不会有影响

357

帖子

0

威望

2071

eV
积分
2428

Level 5 (御坂)

真 掘墓者

4#
发表于 Post on 2017-9-6 04:08:05 | 只看该作者 Only view this author
Jacken_zzq 发表于 2017-9-6 04:01
算过不加参数的了,老板想要看看加了非极性作用会不会有影响

单一默认溶剂,你试试美年达+SMD呗
圣诞刨坟忙

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125145

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2017-9-6 05:10:59 | 只看该作者 Only view this author
用SMD。此时非极性部分会单独输出,总能量减去这个就是只考虑极性的部分
高斯用户没事绝对不要用CPCM,没任何好处,而且高斯里CPCM对中性体系用的校正参数还是错的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

24

帖子

0

威望

156

eV
积分
180

Level 3 能力者

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-9-6 08:29:06 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-9-6 05:10
用SMD。此时非极性部分会单独输出,总能量减去这个就是只考虑极性的部分
高斯用户没事绝对不要用CPCM,没 ...

好的 谢谢老师

本版积分规则 Credits rule

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-22 09:35 , Processed in 0.182628 second(s), 20 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list