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[新手求助] Gas和PCM优化问题

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本帖最后由 CruiseBend 于 2020-10-21 10:17 编辑

老师们好,想问下我现在有一个带电体系(4,1),在gas下b3lyp-d3/6-311g**下优化无虚频,结构合理,而在pcm下从第3步开始结构就不合理,且最终存在虚频。问题如下:
1. 这种情况是什么问题?感觉不像是设置收敛限就能解决的
2. 是否能使用gas下的优化构型,pcm计算sp,以计算相互作用能。
PS-此体系是以静电作用为主导的。

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发表于 Post on 2020-10-21 10:07:03 | 只看该作者 Only view this author
1 换个溶剂模型试试,也有可能结构在溶剂模型下不稳定了
2 溶剂模型影响这么大这么做就不一定能行

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发表于 Post on 2020-10-21 11:12:20 | 只看该作者 Only view this author
光从你的描述上没法准确猜测实际情况
整体带那么多净电荷,优化不带溶剂模型是绝对不能接受的,就算你觉得结果没问题,内行审稿人也不会答应
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-22 15:32:37 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-10-21 11:12
光从你的描述上没法准确猜测实际情况
整体带那么多净电荷,优化不带溶剂模型是绝对不能接受的,就算你觉得 ...

老师好,这是我的input文件,使用了opt=recalc=4消除虚频还是不行,您看要怎么处理

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发表于 Post on 2020-10-22 16:57:05 | 只看该作者 Only view this author
CruiseBend 发表于 2020-10-22 15:32
老师好,这是我的input文件,使用了opt=recalc=4消除虚频还是不行,您看要怎么处理

虚频有多大?
优化出来的结构合理吗?
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-22 16:59:24 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-22 16:57
虚频有多大?
优化出来的结构合理吗?

-30
还算合理

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-22 19:51:41 | 只看该作者 Only view this author
各位老师,是不是因为我在放置复合物时使用的是气态稳定的单体而不是PCM下稳定的单体造成的呢

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发表于 Post on 2020-10-23 18:12:00 | 只看该作者 Only view this author

-30完全可能是格点误差或溶剂模型的数值误差
可以试试提高格点精度
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-24 09:56:23 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-23 18:12
-30完全可能是格点误差或溶剂模型的数值误差
可以试试提高格点精度

老师好,我使用了int=superfine opt=tight 但还是有虚频

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发表于 Post on 2020-10-24 10:02:55 | 只看该作者 Only view this author
CruiseBend 发表于 2020-10-22 19:51
各位老师,是不是因为我在放置复合物时使用的是气态稳定的单体而不是PCM下稳定的单体造成的呢

跟着没关系。优化完了都一样
看虚频对应的是什么模式,微调试试。实在没辙就用calcall
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-27 14:56:16 | 只看该作者 Only view this author
老师们好,我使用了微调+opt-recalc-superfine还是有-30的虚频,请问要怎么处理呢?(每次都是频率计算时候位移不收敛)

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-28 14:53:55 | 只看该作者 Only view this author
有老师能解答下吗?不胜感激

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发表于 Post on 2020-11-1 13:34:38 | 只看该作者 Only view this author
CruiseBend 发表于 2020-10-27 14:56
老师们好,我使用了微调+opt-recalc-superfine还是有-30的虚频,请问要怎么处理呢?(每次都是频率计算时候 ...

加tight啊
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278http://bbs.keinsci.com/thread-633-1-1.html

另外,如果用的是G09 D.01,不要用BJ阻尼的D3校正
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-11-1 16:51:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2020-11-1 13:34
加tight啊
Gaussian中几何优化收敛后Freq时出现NO或虚频的原因和解决方法
http://sobereva.com/278(ht ...

加了tight
但是用的em=gd3bj,g16下的

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发表于 Post on 2020-11-1 17:32:29 | 只看该作者 Only view this author
CruiseBend 发表于 2020-11-1 16:51
加了tight
但是用的em=gd3bj,g16下的

解决办法我博文里都写了,没有遗漏。反复阅读
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