求助关于计算荧光光谱的问题

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-12 15:45:43

本人之前从来没有接触过量子化学这个方面，由于目前需要对荧光的光谱进行分析，目前的计划是计算一些生物气溶胶物质的荧光光谱（例如细菌、花粉等），这几天在论坛中发现用ORCA和Multiwfn这两款应用可以得到一些物质的荧光光谱，学习了这些天但也仅限于用社长老师文章中给的例子，自己不能做到可以自如应用这些软件来完成自己想要的工作，请问大家我应该从哪些方面开始着手，或是我的问题是否还有其它的方法可以解决？
恳请各位老师可以给出建议，谢谢大家了！

rabbitkiller · 发表于 Post on 2020-8-12 15:50:08

要先学习一些原子物理学，分子光谱学的一些东西吧，有了这些东西至少可以分析一下你手头的光谱了。至于计算，可能要学习量子力学，量子化学的东西了。

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-12 15:52:43

rabbitkiller 发表于 2020-8-12 15:50
要先学习一些原子物理学，分子光谱学的一些东西吧，有了这些东西至少可以分析一下你手头的光谱了。至于计算 ...

好的，谢谢您！

thanhtam · 发表于 Post on 2020-8-12 15:54:59

细菌，花粉？
量化能算的是几个到几百个原子的体系，先把你的问题转化为量化能算的问题再说。

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-12 16:19:56

thanhtam 发表于 2020-8-12 15:54
细菌，花粉？
量化能算的是几个到几百个原子的体系，先把你的问题转化为量化能算的问题再说。

请问量化到能算的是几个到几百个原子的体系是什么意思呢，例如量化到什么样的物质才可以呢？

thanhtam · 发表于 Post on 2020-8-12 16:27:26

本帖最后由 thanhtam 于 2020-8-12 16:32 编辑

香蕉酥发表于 2020-8-12 16:19
请问量化到能算的是几个到几百个原子的体系是什么意思呢，例如量化到什么样的物质才可以呢？

量化=量子化学，是名词，不是动词

rabbitkiller · 发表于 Post on 2020-8-12 16:33:01

香蕉酥发表于 2020-8-12 16:19
请问量化到能算的是几个到几百个原子的体系是什么意思呢，例如量化到什么样的物质才可以呢？

细菌和花粉里，到底是哪种物质，哪种分子会发光，这个要首先搞清楚才能继续往下走。

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-12 16:40:46

rabbitkiller 发表于 2020-8-12 16:33
细菌和花粉里，到底是哪种物质，哪种分子会发光，这个要首先搞清楚才能继续往下走。

之前查找了一些资料，发现有色氨酸、NADH、核黄素等，请问这些物质是可以进行计算的吗

thanhtam · 发表于 Post on 2020-8-12 16:47:58

香蕉酥发表于 2020-8-12 16:40
之前查找了一些资料，发现有色氨酸、NADH、核黄素等，请问这些物质是可以进行计算的吗

可以

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-12 17:09:31

thanhtam 发表于 2020-8-12 16:47
可以

明白了谢谢您

sobereva · 发表于 Post on 2020-8-13 08:02:19

先仔细看了此文搞懂基本操作
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva.com/314（http://bbs.keinsci.com/thread-2413-1-1.html）

然后有不懂的光物理方面的概念，去google搜搜、看看wiki的文章补充基本知识。在仪器分析书的UV-Vis那部分一般也会介绍相关背景知识。

然后针对具体问题，弄清楚到底要算什么体系、用什么模型。通常来说，必须把体系简化到<=几百个原子才能通过量化计算研究激发态；对于需要计算荧光、要优化激发态的情况，对于计算资源不是很好的情况，需要控制在100原子以内。

另外，多看看相关研究文章，看大家普遍是怎么研究此类问题的，看多了自然就有思路了。

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-13 08:34:49

sobereva 发表于 2020-8-13 08:02
先仔细看了此文搞懂基本操作
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva ...

明白了，谢谢老师！

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-26 15:46:23

本帖最后由香蕉酥于 2020-8-26 15:47 编辑

rabbitkiller 发表于 2020-8-12 15:50
要先学习一些原子物理学，分子光谱学的一些东西吧，有了这些东西至少可以分析一下你手头的光谱了。至于计算 ...

您好请问下在计算荧光光谱时如何设定激发波长呢，目前我使用的是Gaussian09，如果这个软件不可以设定激发波长的话，还有其他的方法吗？

香蕉酥 · 发表于 Post on 2020-8-26 15:47:12

sobereva 发表于 2020-8-13 08:02
先仔细看了此文搞懂基本操作
Gaussian中用TDDFT计算激发态和吸收、荧光、磷光光谱的方法
http://sobereva ...

老师，请问下在计算荧光光谱时如何设定激发波长呢，目前我使用的是Gaussian09，如果这个软件不可以设定激发波长的话，还有其他的方法吗？

pwzhou · 发表于 Post on 2020-8-26 15:49:58

香蕉酥发表于 2020-8-26 15:47
老师，请问下在计算荧光光谱时如何设定激发波长呢，目前我使用的是Gaussian09，如果这个软件不可以设定激 ...

这个不是做实验，不需要指定激发波长，计算荧光光谱请用TDDFT优化第一激发态构型。

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