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[MOPAC] MOPAC2012要密码,如何获取?

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linux版本的MOPAC2012要密码,如何获取呢?官网找不到索取密码的链接了,先前要了没有给。

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发表于 Post on 2015-1-28 11:11:00 | 只看该作者 Only view this author
密码可以用这个:1591535a16518252
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 11:33:18 | 只看该作者 Only view this author
谢谢 刚才翻看到你的先前的帖子,我安装了一下,还没有安装上。再试试!谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 11:49:26 | 只看该作者 Only view this author
按照您提供的先前的方法安装了,但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候,总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错,mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 11:49:39 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-28 11:11
密码可以用这个:1591535a16518252

按照您提供的先前的方法安装了,但到了MOPAC2012 [license]这一步运行的时候,总出现  /home/mopac/MOPAC2012.exe: permission denied报错,mopac已经给了chmod 777的权限了。不知道哪些除了问题?

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发表于 Post on 2015-1-28 11:58:08 | 只看该作者 Only view this author
你用ls -l查看一下,到底是否是777了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 12:15:18 | 只看该作者 Only view this author
应该是777,见图片。倒数第二行,是安装所在文件夹。我用的centos 6.5

2.jpg (46.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 84)

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1.jpg (46.26 KB, 下载次数 Times of downloads: 74)

权限查看777

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 12:16:53 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-28 11:58
你用ls -l查看一下,到底是否是777了。

会了 帮我看看什么问题,谢谢。是否linux不认exe文件?

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发表于 Post on 2015-1-28 12:50:12 | 只看该作者 Only view this author
明显没有可执行权限,MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r,没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权限
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 13:01:54 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lao7 于 2015-1-28 13:26 编辑

按照Chmod -x不报权限的错误了,不过还要经过实践检验,再请教,谢谢

license已经安装上了,再次请教一下:mopac2012多核并行是默认的吗?谢谢!能否给我一个你做过的链接,让我看看如何做输入文件?谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-1-28 13:46:26 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-1-28 12:50
明显没有可执行权限,MOPAC2012.exe权限是rw-rw-r,没x。
应当用chmod +x MOPAC2012.exe给它增加可执行权 ...

Sob,请教一个问题:
你以前的贴在“大体系弱相互作用解决之道”,牵涉大MOPAC2012的使用,下面的例子:
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
PM7 CHARGE=-10 MOZYME
molecule
All coordinates are Cartesian
O       4.71271832 0   9.26971072 0  -7.55066164 0
C       4.13662696 0   9.48826045 0  -8.82968461 0
C       2.75025629 0   8.84701245 0  -8.99475234 0
...(剩余的坐标)
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。
请问:
1)这里面, CHARGE=-10,如何知道一个体系带的电荷呢?比如用Gview输出一个笛卡尔坐标,哪一行是体系电荷?
2)如果优化结构,是不是要加Opt关键词?(要挨个写1?几百个原子)
3)生成什么样的文件,能用你的波函数分析软件打开?进行reduced density gradient分析(弱力的等作用面)?谢谢。

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1 根据化学知识和实际情况判断带多少电荷。笛卡尔坐标和电荷无关。
2 用ultraedit的列编辑模式很简单就能插入一列1。如果只写坐标不写0或1,也默认是优化所有原子。
3 Multiwfn不支持mopac产生的波函数。Multiwfn可以在promolecular近似下做RDG分析,只需要提供原子坐标就够了,此帖有说明
使用Multiwfn图形化研究弱相互作用
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