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[Gaussian/gview] 求问以过渡态做irc正常结束,但用Gaussview等可视化软件都打不开irc的log文件。

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@NO)JVPH5JV5NP](_(C(C19.png (23.64 KB, 下载次数 Times of downloads: 50)

irc正常结束

irc正常结束

P52@W3JD(%U8GPJSN94CEWV.png (10.29 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

用Gaussview打开出现警告

用Gaussview打开出现警告

%8$XSS2ZA`B%I{~Q3YSAE8W.png (10.38 KB, 下载次数 Times of downloads: 33)

点击警告提醒的OK又出现对话框说不能读取,这到底是什么原因呢?

点击警告提醒的OK又出现对话框说不能读取,这到底是什么原因呢?

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发表于 Post on 2017-10-24 17:24:18 | 只看该作者 Only view this author
上传压缩后的输出文件。
如果gview太老而Gaussian较新,打不开也是正常的。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-24 19:10:18 | 只看该作者 Only view this author
@sobereva 这是输出的log文件,请帮忙看看,谢谢咯!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-24 19:21:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-24 17:24
上传压缩后的输出文件。
如果gview太老而Gaussian较新,打不开也是正常的。

附件是输出的log文件,请帮忙看看是什么问题,谢谢咯!

TSb.irc.fo.zip

1.2 MB, 下载次数 Times of downloads: 23

log文件

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发表于 Post on 2017-10-24 19:36:39 | 只看该作者 Only view this author
chenzhiyong 发表于 2017-10-24 19:21
附件是输出的log文件,请帮忙看看是什么问题,谢谢咯!


用GV6.0打开后就是下图这样的,只有一个点,跑IRC关键词为何如此复杂,用你的算法和基组,感觉这样就够了#p m06l/def2SVP  irc(forward,cal
cfc,stepsize=15)



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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-24 20:04:19 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-10-24 19:36
用GV6.0打开后就是下图这样的,只有一个点,跑IRC关键词为何如此复杂,用你的算法和基组,感觉这样就够 ...

GV6.0打开也是报错的,只是能看到结构比其他可视化软件厉害一点,但是也没有irc路径。从输出的log文件中可以明确看到是跑了10个点的,和正常能打开的irc是一样的。至于多的那些关键字只是习惯了每个输入文件都加,只是多输出一些结果,对计算没有印象。我现在就是想弄清楚为甚么看不到irc路径,到底是哪里出错了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-24 22:13:27 | 只看该作者 Only view this author
xujian 发表于 2017-10-24 19:36
用GV6.0打开后就是下图这样的,只有一个点,跑IRC关键词为何如此复杂,用你的算法和基组,感觉这样就够 ...

非常感谢,我前都是喜欢通过读取过渡态的chk文件结构和波函数来进行irc计算,刚刚把过渡态结构取出来跑了irc,结构能打开了,是你给了我灵感,非常感谢。虽然我还是不知道为什么这几个irc的log文件GV打不开(都是,但是问题也算解决了。

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发表于 Post on 2017-10-25 12:28:26 | 只看该作者 Only view this author
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处,写IOP(6/7=3) 完全添乱,导致输出文件极度庞大
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2017-10-25 14:14:40 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-25 12:28
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处,写IOP(6/7=3) 完全添乱,导致输出文件极度庞大

嗯嗯,谢谢sob老师,我想应该也是这样

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发表于 Post on 2017-12-27 14:21:25 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-10-25 12:28
8成是因为用了geom=check
写GFINPUT毫无用处,写IOP(6/7=3) 完全添乱,导致输出文件极度庞大

卢老师,请问不使用geom=check还可以使用rcfc吗?是不是直接拷贝过渡态的原子坐标计算就可以解决这个打不开log文件的问题啊?

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发表于 Post on 2017-12-27 19:16:36 | 只看该作者 Only view this author
amwfhv 发表于 2017-12-27 14:21
卢老师,请问不使用geom=check还可以使用rcfc吗?是不是直接拷贝过渡态的原子坐标计算就可以解决这个打不 ...


可以,读取结构和读取力常数矩阵是两码事

只是自行修改输出文件还达不到目的,很难正好满足gview对格式的要求
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发表于 Post on 2017-12-27 20:15:56 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2017-12-27 19:16
可以,读取结构和读取力常数矩阵是两码事

只是自行修改输出文件还达不到目的,很难正好满足gview对 ...

卢老师,晚上好,另外是否只加guess=read就可以结合rcfc使用了啊?

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发表于 Post on 2017-12-27 20:23:03 | 只看该作者 Only view this author
amwfhv 发表于 2017-12-27 20:15
卢老师,晚上好,另外是否只加guess=read就可以结合rcfc使用了啊?

这都不是一码事

读取初猜波函数
读取初猜结构
读取初始Hessian

这三条是彼此独立的,都用也行,都不用也行,只用任何一个或两个也行
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