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[综合交流] pdb文件连接成轨迹

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楼主
各位,我有段程序,想输出轨迹,目前只会每隔多少步输出个pdb,请问有什么办法把这些pdb连接成类似xtc似的轨迹文件么?
多谢!

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发表于 Post on 2015-3-18 17:57:00 | 只看该作者 Only view this author
直接用cat把pdb合并,就构成了多帧的pdb,放到VMD里就可以当轨迹看了。RCSB上NMR测的蛋白质结构的pdb文件一般就是这样多帧的。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-3-19 16:11:07 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-3-18 17:57
直接用cat把pdb合并,就构成了多帧的pdb,放到VMD里就可以当轨迹看了。RCSB上NMR测的蛋白质结构的pdb文件一 ...

搜嘎,多谢!

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