dalton计算报错，求助

Yin

.dal文件

部分.mol文件

在服务器里也就2秒就出了log文件，如下

请问大家，这是哪里出问题了？

Yin

.dal文件
.mol文件

sobereva

你贴的log的截图里没有任何报错信息

Yin

sobereva 发表于 2018-4-3 15:32
你贴的log的截图里没有任何报错信息

老师，计算出来的log文件除了dal文件和mol文件的一些信息，就只有截图里面的信息了，完整log文件信息如下。不知道什么原因，就只是计算到这里了。


     ************************************************************************
     *************** Dalton - An Electronic Structure Program ***************
     ************************************************************************

    This is output from DALTON 2015.0
   ----------------------------------------------------------------------------
    NOTE:

    Dalton is an experimental code for the evaluation of molecular
    properties using (MC)SCF, DFT, CI, and CC wave functions.
    The authors accept no responsibility for the performance of
    the code or for the correctness of the results.

    The code (in whole or part) is provided under a licence and
    is not to be reproduced for further distribution without
    the written permission of the authors or their representatives.

    See the home page "http://daltonprogram.org" for further information.

    If results obtained with this code are published,
    the appropriate citations would be both of:

       K. Aidas, C. Angeli, K. L. Bak, V. Bakken, R. Bast,
       L. Boman, O. Christiansen, R. Cimiraglia, S. Coriani,
       J. Cukras, P. Dahle, E. K. Dalskov, U. Ekstroem,
       T. Enevoldsen, J. J. Eriksen, P. Ettenhuber, B. Fernandez,
       L. Ferrighi, H. Fliegl, L. Frediani, K. Hald, A. Halkier,
       C. Haettig, H. Heiberg, T. Helgaker, A. C. Hennum,
       H. Hettema, E. Hjertenaes, S. Hoest, I.-M. Hoeyvik,
       M. F. Iozzi, B. Jansik, H. J. Aa. Jensen, D. Jonsson,
       P. Joergensen, M. Kaminski, J. Kauczor, S. Kirpekar,
       T. Kjaergaard, W. Klopper, S. Knecht, R. Kobayashi, H. Koch,
       J. Kongsted, A. Krapp, K. Kristensen, A. Ligabue,
       O. B. Lutnaes, J. I. Melo, K. V. Mikkelsen, R. H. Myhre,
       C. Neiss, C. B. Nielsen, P. Norman, J. Olsen,
       J. M. H. Olsen, A. Osted, M. J. Packer, F. Pawlowski,
       T. B. Pedersen, P. F. Provasi, S. Reine, Z. Rinkevicius,
       T. A. Ruden, K. Ruud, V. Rybkin, P. Salek, C. C. M. Samson,
       A. Sanchez de Meras, T. Saue, S. P. A. Sauer,
       B. Schimmelpfennig, K. Sneskov, A. H. Steindal,
       K. O. Sylvester-Hvid, P. R. Taylor, A. M. Teale,
   ----------------------------------------------------------------------------

  Ove Christiansen,         Aarhus University,            Denmark     (CC module)
  Renzo Cimiraglia,         University of Ferrara,        Italy       (NEVPT2)
  Erik K. Dalskov,          UNI-C,                        Denmark     (SOPPA)
  Heike Fliegl,             University of Oslo,           Norway      (CCSD(R12))
  Maria Francesca Iozzi,    University of Oslo,           Norway      (RPA)
  Ola B. Lutnaes,           University of Oslo,           Norway      (DFT Hessian)
  Christian Neiss,          Univ. Erlangen-Nuernberg,     Germany     (CCSD(R12))
  Anders Osted,             Copenhagen University,        Denmark     (QM/MM)
  K. O. Sylvester-Hvid,     University of Copenhagen,     Denmark     (MC-SCRF)
  Andrew M. Teale,          University of Nottingham,     England     (DFT-AC, DFT-D)
  David P. Tew,             University of Bristol,        England     (CCSD(R12))
--------------------------------------------------------------------------------

     Date and time (Linux)  : Tue Apr  3 15:06:11 2018
     Host name              : localhost.localdomain

* Work memory size             :  1536000000 = 11.444 gigabytes.

* Directories for basis set searches:
   1) /home/wangxin/yx/Co-tpa
   2) /usr/local/dalton/basis


Compilation information
-----------------------

Who compiled             | wangxin
Host                     | localhost.localdomain
System                   | Linux-2.6.32-431.el6.x86_64
CMake generator          | Unix Makefiles
Processor                | x86_64
64-bit integers          | OFF
MPI                      | ON
Fortran compiler         | /usr/local/bin/mpif90
Fortran compiler version | GNU Fortran (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-4)
C compiler               | /usr/local/bin/mpicc
C compiler version       | gcc (GCC) 4.4.7 20120313 (Red Hat 4.4.7-4)
C++ compiler             | /usr/local/bin/mpicxx
C++ compiler version     | unknown
BLAS                     | /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_gf_lp64.so;/opt/
                          | intel/mkl/lib/intel64/libmkl_sequential.so;/opt/in
                          | tel/mkl/lib/intel64/libmkl_core.so;/usr/lib64/libp
                          | thread.so;/usr/lib64/libm.so
LAPACK                   | /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_lapack95_lp64.a;
                          | /opt/intel/mkl/lib/intel64/libmkl_gf_lp64.so
Static linking           | OFF
Last Git revision        | d34efb170c481236ad60c789dea90a4c857c6bab
Configuration time       | 2017-09-19 18:25:44.336195

* MPI run using 8 processes.


   Content of the .dal input file
----------------------------------

**DALTON INPUT
.RUN RESPONSE
**WAVEFUNCTION
.DFT
B3LYP
*SCF INPUT
.THRESHOLD
1.0D-6
**RESPONSE
*QUADRATIC
.DIPLEN
.TWO-PHOTON
.ROOTS
5
**END OF DALTON INPUT



   Content of the .mol file
----------------------------

ATOMBASIS


Atomtypes=5 Charge=+1 Nosymm
Charge=77.0  Atoms=1    basis=stuttgart_rsc_1997_ecp  ECP=stuttgart_rsc_1997_ec
Ir01         -2.125942         -0.591484         -0.007559
Charge=9.0   Atoms=4    basis=6-31G*
F001         -2.481210          7.679847          5.525559
F002         -6.716087          8.273221         -2.169406
F003        -10.055233         -2.821361          5.971535
F004        -11.349695         -3.068915         -2.732544
Charge=7.0   Atoms=5    basis=6-31G*
N001          2.012558         -0.251334         -1.096041
N002         -0.757780         -4.469202         -0.340151
N003         -0.899510          0.003779          3.647171
N004         -3.624495         -0.939194         -3.573472
N005          5.735319         -2.137280         -0.559359
Charge=6.0   Atoms=48   basis=6-31G*
C001          3.879608          1.549575         -1.215094
C002         -3.276785          2.997106          0.496998
C003          1.757445         -4.820691         -0.670853
C004          6.219089          0.419519         -0.806913
C005          3.686856          4.185743         -1.833034
C006          3.182299         -2.458534         -0.755890
C007          1.419184          5.283674         -2.658845
C008         -5.671068         -1.519340          0.895730
C009          2.759000         -7.245210         -0.984547
C010          8.534003          1.825475         -0.602823
C011         -2.528454          4.078029          2.836479
C012          5.935630          5.644612         -1.723430
C013          0.179524         -1.778232          5.094702
C014         -1.198086          2.398062          4.556130
C015          1.145174         -9.314460         -0.935414
C016         -4.739433          4.437077         -1.160292
C017         -2.299797         -0.544241         -5.701304
C018         10.890492          0.759670          0.035905
C019         -1.428633         -8.932735         -0.583925
C020        -10.769549         -2.961201          1.617606
C021          7.547566         -4.091257         -0.098266
C022         -7.275446         -1.938859         -1.218873
C023          8.341251          4.482430         -1.011003
C024          1.307690          7.812128         -3.290013
C025         -6.117043         -1.585480         -3.692525
C026         10.550341          5.935630         -0.725655
C027         -4.590145          8.046454          1.696974
C028         -2.297907         -6.474202         -0.304246
C029         -3.193637          6.589475          3.352374
C030         -5.353594          6.910728         -0.542351
C031          1.065806         -1.298242          7.505992
C032          5.756106          8.218419         -2.384834
C033          7.876379         -4.990767          2.352709
C034         13.016434          2.250664          0.279679
C035         12.842579          4.858486         -0.100155
C036          3.494104          9.288004         -3.135056
C037         -6.642387         -1.827365          3.327808
C038          8.947853         -5.058797         -2.108934
C039         -9.151944         -2.534123          3.639613
C040         -9.788781         -2.647506         -0.782347
C041          0.825810          1.148953          8.450855
C042         -3.369382         -0.754001         -8.076689
C043         10.699629         -6.965531         -1.647841
C044         -7.288674         -1.825475         -6.052793
C045         -0.308025          2.991436          6.980648
C046          9.631934         -6.901280          2.793015
C047         11.039780         -7.887717          0.797464
C048         -5.914843         -1.405956         -8.242985
Charge=1.0   Atoms=29   basis=6-31G*
H001         -0.251334          4.113934         -2.794905
H002          4.762110         -7.513551         -1.292573
H003          0.291018         -3.649061          4.267002
H004          1.902954        -11.204186         -1.184858
H005         -5.404617          3.690635         -2.951752
H006         -0.332592         -0.035905         -5.434852
H007         11.054898         -1.250999          0.374166
H008         -2.755221        -10.495539         -0.534792
H009        -12.721636         -3.507332          1.899175
H010         -0.464873          8.634159         -3.917402
H011         10.470973          7.967085         -0.978878
H012         -5.079584          9.983423          2.144839
H013         -4.285899         -6.060352         -0.028346
H014          1.901064         -2.810023          8.611482
H015          7.422844          9.407057         -2.352709
H016          6.780337         -4.181964          3.887167
H017         14.811673          1.392728          0.782347
H018         14.503648          6.047124          0.105825
H019          3.433632         11.277886         -3.637723
H020         -5.499103         -1.506112          4.998326
H021          8.668174         -4.308576         -3.998660
H022          1.502332          1.613826         10.333023
H023         -2.231767         -0.406291         -9.745318
H024         11.805119         -7.727090         -3.201196
H025         -9.265327         -2.328143         -6.143500
H026         -0.531013          4.894391          7.689296
H027          9.907834         -7.611817          4.697859
H028         12.411721         -9.373042          1.147064
H029         -6.829470         -1.583591        -10.072240


       *******************************************************************
       *********** Output from DALTON general input processing ***********
       *******************************************************************

--------------------------------------------------------------------------------
   Overall default print level:    0
   Print level for DALTON.STAT:    1

    Parallel calculation using MPI
    AO-direct calculation (in sections where implemented)
    HERMIT 1- and 2-electron integral sections will be executed
    "Old" integral transformation used (limited to max 255 basis functions)
    Wave function sections will be executed (SIRIUS module)
    Dynamic molecular response properties section will be executed (RESPONSE module)
--------------------------------------------------------------------------------

sobereva

Charge=77.0  Atoms=1    basis=stuttgart_rsc_1997_ecp  ECP=stuttgart_rsc_1997_ec
这一行末尾少了个p

bomsaude

没算过这样的体系，但从这文件没看出错误提示，请检查以下内容：

1 "Old" integral transformation used (limited to max 255 basis functions)，这个提示和你的计算有关吗？

2 ECP=stuttgart_rsc_1997_ec中p都没了？mol文件中也是这样吗？

3 分子坐标单位是bohr吗？不是的话，在mol中应该指明单位。

等等。。。。。。

sobereva

已测试，把p补上去之后，任务可以正常跑
另注意6L说的单位问题

Yin

bomsaude 发表于 2018-4-3 17:42
没算过这样的体系，但从这文件没看出错误提示，请检查以下内容：

1 "Old" integral transformation used ...

好的 非常感谢

Yin

sobereva 发表于 2018-4-3 17:54
已测试，把p补上去之后，任务可以正常跑
另注意6L说的单位问题

好的 谢谢老师