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[新手求助] 化学反应中的构型转变问题请教——如何通过理论计算获得

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本帖最后由 阿呆 于 2018-4-16 09:23 编辑

在有机合成反应过程中,会出现一个问题,比如A本是E构型,但是A经过化学反应得到了化合物B,而得到的化合物B为Z构型,那么问题来了,如果通过理论计算的方法得到其过程中A(E)→B(Z)构型转变。虚心求教~~~

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发表于 Post on 2018-4-16 09:01:34 | 只看该作者 Only view this author
个人理解哈:
可否计算过渡态的速率?因为早上看文献,正好看到一个我这个方向计算速率的。我看他的引用文献是:
Fernández-Ramos, A.; Miller, J. A.; Klippenstein, S. J.; Truhlar, D.
G. Modeling the Kinetics of Bimolecular Reactions. Chem. Rev. 2006,
106, 4518−4584.
我也没看哈,不确定是不是。你可以看看试试。
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

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发表于 Post on 2018-4-16 09:15:29 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 liyuanhe211 于 2018-4-16 09:21 编辑

Z/E是构型,和构象转变两码事。
与(通常的)构象转变不同,对构型的转化一般要根据化合物所处的环境提出合适的反应机理,比如酸催化、光照、有EWG时亲核试剂可逆加成、高温下直接变成双自由基发生旋转等等。有了合理的机理之后做常规的找过渡态、算速率之类的计算就可以了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-16 09:22:56 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2018-4-16 09:15
Z/E是构型,和构象转变两码事。
与(通常的)构象转变不同,对构型的转化一般要根据化合物所处的环境提出 ...

谢谢纠正错误,失误失误~~~

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2018-4-16 09:26:24 | 只看该作者 Only view this author
小范范1989 发表于 2018-4-16 09:01
个人理解哈:
可否计算过渡态的速率?因为早上看文献,正好看到一个我这个方向计算速率的。我看他的引用文 ...

非常感谢~您的文章是否可以拜读一下?

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发表于 Post on 2018-4-16 10:03:18 | 只看该作者 Only view this author
阿呆 发表于 2018-4-16 09:26
非常感谢~您的文章是否可以拜读一下?

General Approach To Compute Phosphorescent OLED Efficiency
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jpcc.8b00831
不是我的文章哈,是我早上刚看的。里面有这句话 the knr(T) decay rate is
computed with canonical variational transition (CVT) state
theory24
感觉,可以来计算速率。
个人见解,不一定对哈
https://www.x-mol.com/groups/fan_jianzhong

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发表于 Post on 2018-4-16 14:47:46 | 只看该作者 Only view this author
如果是反应过程中,双键变成单键有机会旋转的话,可以计算一下单键旋转的能垒,如果旋转臂后续的基元过程更低的话,那么就可以构型转换了吧。

具体不知道啊

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