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[VMD] VMD Gromacs 周期性轨迹 胡乱连键问题

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本帖最后由 haijiayuan 于 2022-9-25 18:12 编辑

我用gromacs跑了一个npt过程,在vmd中查看trr轨迹,会出现成键错误,如图所示,请问怎么解决?



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发表于 Post on 2022-9-23 16:15:54 | 只看该作者 Only view this author
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发表于 Post on 2022-9-23 16:17:42 | 只看该作者 Only view this author
Drawing method选用dynamic bonds试试?

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发表于 Post on 2022-9-24 00:25:25 | 只看该作者 Only view this author
老生常谈



根本不是什么“乱码”,不要乱用词
好好写标题,别就把几个关键词随便往标题上一摆,没有文章标题是这么写的。好好看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-25 18:10:04 | 只看该作者 Only view this author
牧生 发表于 2022-9-23 16:15
http://bbs.keinsci.com/thread-20047-1-1.html

好的,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-25 18:10:42 | 只看该作者 Only view this author
时光故事去学习 发表于 2022-9-23 16:17
Drawing method选用dynamic bonds试试?

可以了,谢谢

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2022-9-25 18:12:54 | 只看该作者 Only view this author

好的,sob老师,已经修改标题

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