freq分析文件太大,GV打不开

naf · 发表于 Post on 2018-8-27 15:42:24

各位好，我有一个振动分析的结果文件，大小是6G。我自己的GaussView打不开。请问有什么解决办法吗？谢谢。

beefly · 发表于 Post on 2018-8-28 16:30:36

naf 发表于 2018-8-27 18:25
感谢sob君。我没用额外的东西。就是体系是蛋白质，比较大，用ONIOM做的。
我用formchk把chk文件转成fchk文 ...

g09频率计算的chk文件如果超大，formchk加大内存可能会出现内存泄露的问题，导致力常数矩阵全是无效的0。不知道g16解决了没有。

如果仅仅是画红外光谱图，用输出的log文件更方便

柒月小鱼 · 发表于 Post on 2018-8-28 10:42:54

请教楼主
你为什么要做振动分析的时候用oniom了，我们考虑做oniom是为了考虑环境对于内部的影响对吧，
但是到了振动分析的时候（比如做蛋白的红外活性）是应该直接考虑最关键部位，否则光谱是包含了外层的
我的理解对么，还请指教

naf · 发表于 Post on 2018-8-27 18:25:33

感谢sob君。我没用额外的东西。就是体系是蛋白质，比较大，用ONIOM做的。
我用formchk把chk文件转成fchk文件，提示我mem不够。在当前目录下新建了一个Default.Route文件，里面输入-U- 90GB解决了。得到了3.75G的fchk文件。还是打不开。不过fchk文件确实小了很多，感谢。
我自己再想办法吧。

sobereva · 发表于 Post on 2018-8-27 15:49:28

估计你用了#P，或者一堆没必要有的关键词，比如pop=full之类，才导致文件这么大
可以改为打开fch

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[Gaussian/gview] freq分析文件太大,GV打不开