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[建模与可视化] 基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构(视频)

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本视频演示如何利用VMD和GaussView基于分子晶体cif文件抠出分子团簇结构。这样的团簇结构在使用Multiwfn中的Hirshfeld surface分析、promolecular近似下的NCI分析和IGM分析研究分子晶体中的弱相互作用的时候都需要提供。
https://www.bilibili.com/video/av35864488/


后记:这种抠团簇的方法已经完全过时了!下文介绍的Multiwfn的几何操作功能中已经直接有了抠团簇的选项,远比视频里的做法方便得多得多
Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍
http://sobereva.com/610http://bbs.keinsci.com/thread-24674-1-1.html

以下两篇文章里的例子都用了Multiwfn的这个功能
使用Multiwfn做Hirshfeld surface分析直观展现分子晶体和复合物中的相互作用
http://sobereva.com/701http://bbs.keinsci.com/thread-43178-1-1.html
使用Multiwfn做IGMH分析非常清晰直观地展现化学体系中的相互作用
http://sobereva.com/621http://bbs.keinsci.com/thread-28147-1-1.html

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