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[新手求助] 用Gaussian09预测溶解性的问题

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本帖最后由 naoki 于 2019-1-15 19:04 编辑

看到Sob老师在《使用Multiwfn预测晶体密度、蒸发焓、沸点、溶解自由能等性质》(http://bbs.keinsci.com/thread-3571-1-1.html)一文中的回复:“考察分子在某个溶剂中的溶解性,不能光看分子在某个溶剂中的溶解自由能,还得看溶质与溶质分子之间的结合强度,只有与溶剂结合比起与溶质分子自己结合使得自由能降低得更多,物质才能溶解”。我想请教一下,如果要判断两种液体是否互溶,比如正己烷和水,是不是可以分别计算正己烷分子在正己烷中的溶剂化自由能ΔG1、正己烷分子在水中的溶剂化自由能ΔG2、水分子在水中的溶剂化自由能ΔG3以及水分子在正己烷中溶剂化自由能ΔG4,如果ΔG2-ΔG1>0且ΔG4-ΔG3>0,说明在标况下二者互溶不能自发进行?谢谢~
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发表于 Post on 2019-5-14 03:28:21 | 只看该作者 Only view this author
naoki 发表于 2019-5-13 21:15
Sob老师好,时隔四个月,我听您的建议学习了GROMACS,现在再回头看这个问题,还是想问问您,跑完不互溶界 ...

可以尝试计算其中一种分子在自己作为溶剂的环境下和在另一种分子作为溶剂的环境下的溶解自由能试图说明这点
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-13 21:15:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-16 05:00
标准定得太苛刻

讨论这种问题最理想的做法就是做分子动力学,十分可靠,原理严格,别人也信,强相互作用 ...

Sob老师好,时隔四个月,我听您的建议学习了GROMACS,现在再回头看这个问题,还是想问问您,跑完不互溶界面的分子动力学,也分析了密度分布等,怎么去解释两相不互溶的原因呢。。也许这个问题听起来很蠢,但我想从相互作用和能量角度去解释,而不是一句相似相溶就完了。还请老师赐教。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-16 09:36:12 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-1-16 05:00
标准定得太苛刻

讨论这种问题最理想的做法就是做分子动力学,十分可靠,原理严格,别人也信,强相互作用 ...

好的,谢谢Sob老师!我去研究一下gromacs。
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发表于 Post on 2019-1-16 05:00:48 | 只看该作者 Only view this author
标准定得太苛刻

讨论这种问题最理想的做法就是做分子动力学,十分可靠,原理严格,别人也信,强相互作用还可以充分体现。用免费的gromacs实现极其容易。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-15 23:20:43 | 只看该作者 Only view this author

Sob老师,我按这个方式在M062X/6-31g*水平用SMD模型算了水和乙醇体系,发现ΔG2-ΔG1>0且ΔG4-ΔG3>0…表明乙醇和水的互溶不能自发进行,可是乙醇和水明显是可以互溶的,这是不是因为隐式溶剂模型没考虑氢键的原因呢,如果体系是两种没有氢键或水桥这种强相互作用,这种方法是不是就行得通了呢?还想问一下如果要研究有氢键体系的两液体是不是只能用显式+隐式的混合溶剂模型了呢?谢谢!
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-1-15 19:13:38 | 只看该作者 Only view this author

谢谢Sob老师~
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发表于 Post on 2019-1-15 19:10:52 | 只看该作者 Only view this author
可以这么说
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