nbo计算无法正常完成的问题

尚礼明哲 · 发表于 Post on 2019-2-13 10:37:10

求助，我在计算nbo计算时出现问题：有一个任务计算总是停留在“Replace BD/BD* pair(s) in Lewis set by LP/LP using directed NBO search”语句，之后非常长的时间内停止更新chk和log，故人为停止计算。其他同批次任务均正常结束，对应语句位置均为“Strongly delocalized structure accepted”。
输入文件：
%chk=nbo6.chk
%nprocshared=40
%mem=20GB
#p genecp m06 pop=nbo6 int=ultrafine guess=read geom=check

Molecule Name

0 3 -2 1 2 3

C H N Cl O P 0
6-31++G**
****
Hf Ni 0
lanl2dz
****

Hf Ni 0
lanl2dz
第一次使用nbo,谢谢帮助！

jkq · 发表于 Post on 2025-3-8 09:17:33

您好，我在使用NBO计算时想重新定义片段，用了choose指令，输出文件提示无法识别，请问一下是什么问题，输入文件：
%chk=NBO-c8TS0-1-AC-0.chk
%mem=252800MB
%nprocshared=64
# m06l/6-31g(d,p) sp pop=nboread

Title Card Required

1 1
Si                2.06797800 -0.65406100 0.16018200
O                2.96037400 -2.06654700 -0.48497500
O                2.78162700 0.23545800 1.33919800
O                3.15809400 0.39484800 -1.02107100
C                2.49616200 0.17139300 2.73613500
H                3.34701600 0.60391900 3.26468800
H                1.60152100 0.75919400 2.96844100
H                2.34562700 -0.85630000 3.07119500
C                4.38965900 -2.18423100 -0.64739900
H                4.91388900 -1.74999100 0.20650200
H                4.62009600 -3.24456800 -0.73581600
H                4.68274700 -1.66859700 -1.56141900
C                2.96152200 0.40094300 -2.44751000
H                2.74824000 -0.62263000 -2.75769200
H                2.13116200 1.05524600 -2.72440500
H                3.88065200 0.74100500 -2.92691800
H                3.30940000 1.33853400 -0.69299800
O                1.53136500 -2.08012300 1.17413700
H                2.35509600 -2.60714800 0.36649400
H                0.60538700 -2.34753600 1.17495100
C                0.46622300 -0.15158500 -0.64259100
H                0.50259000 0.94394300 -0.73853700
H                0.44852400 -0.51826500 -1.67796400
C                -0.82634900 -0.55998400 0.06593900
H                -0.94293900 -1.65399500 0.02634700
H                -0.77689100 -0.29834100 1.13380000
C                -2.06763800 0.07337000 -0.54610600
H                -2.10941900 -0.17645800 -1.61592000
H                -1.97125400 1.16773500 -0.50216900
C                -3.35961000 -0.35527100 0.13168100
H                -3.45099600 -1.45039300 0.08322600
H                -3.30880700 -0.11129600 1.20306500
C                -4.59977500 0.28274300 -0.47504400
H                -4.64612900 0.04181000 -1.54714600
H                -4.50847600 1.37766400 -0.42431900
C                -5.89298600 -0.14982800 0.19782200
H                -5.98328100 -1.24493800 0.14607200
H                -5.84485700 0.08905800 1.27058000
C                -7.13447100 0.48894700 -0.40726300
H                -7.03982600 1.58214400 -0.35372600
H                -7.17711300 0.24967200 -1.47859100
C                -8.41901700 0.04833900 0.27127100
H                -8.41494300 0.30603900 1.33555300
H                -9.29843100 0.51768900 -0.17652400
H                -8.55366700 -1.03611300 0.20118800
O                3.76865339 2.66386209 -0.54620944
C                4.20744358 3.84309348 -0.56735283
C                5.10737172 4.03388341 -1.80239475
H                4.53899390 3.84885188 -2.68986869
H                5.48046938 5.03656728 -1.82037237
H                5.92792638 3.34879282 -1.75505637
C                5.02548160 4.10940041 0.70994683
H                5.39857891 5.11208440 0.69196883
H                4.40020626 3.97683801 1.56805985
H                5.84603650 3.42431014 0.75728586

$nbo
  CHOOSE 1 46-55
  CHOOSE 2 1-45
$end

薛定谔的？？？ · 发表于 Post on 2024-7-10 10:09:31

lxb323 发表于 2022-11-27 15:54
您好，这个问题您解决了吗？我现在也遇到了同样的问题

您好，请问您的问题解决了吗？我在计算时也是遇到了同样的问题

薛定谔的？？？ · 发表于 Post on 2024-7-10 10:08:39

您好，请问您的问题解决了吗？我在计算时也是遇到了同样的问题

lxb323 · 发表于 Post on 2022-11-27 20:45:07

granvia 发表于 2022-11-27 16:17
如果不算NBO，只是获取NPA分析，可以加上自定义关键词NOBOND

好的，非常感谢，我试一下

granvia · 发表于 Post on 2022-11-27 16:17:58

lxb323 发表于 2022-11-27 15:54
您好，这个问题您解决了吗？我现在也遇到了同样的问题

如果不算NBO，只是获取NPA分析，可以加上自定义关键词NOBOND

lxb323 · 发表于 Post on 2022-11-27 15:54:09

您好，这个问题您解决了吗？我现在也遇到了同样的问题

sobereva · 发表于 Post on 2019-2-14 06:21:08

尚礼明哲发表于 2019-2-13 20:43
谢谢sob老师。不过我只有这一个结构不能正常完成，其他的都能正常结束。nbo6的manual的NBO分析一节有关NB ...

花钱的程序，官方还有论坛，何不问开发者？

尚礼明哲 · 发表于 Post on 2019-2-13 20:43:27

sobereva 发表于 2019-2-13 16:05
如果NBO6一次都没使用成功过，说明是NBO配置的问题或者和当前Gaussian/软件环境不兼容

谢谢sob老师。不过我只有这一个结构不能正常完成，其他的都能正常结束。nbo6的manual的NBO分析一节有关NBO search有写“The Lewis structure is accepted if all orbitals of the formal Lewis structure exceed the occupancy threshold”，此时该位置会出现“Structure accepted: No low occupancy Lewis orbitals”类似语句。那我这个任务里出现的语句“Replace BD/BD* pair(s) in Lewis set by LP/LP using directed NBO search”是不是代表没有被NBO接受而需要有相关计算而导致了问题的出现呀？那您知道该如何解决这个问题吗？麻烦啦！

granvia · 发表于 Post on 2019-2-13 20:33:11

去掉弥散函数就应该okay了

sobereva · 发表于 Post on 2019-2-13 16:05:52

如果NBO6一次都没使用成功过，说明是NBO配置的问题或者和当前Gaussian/软件环境不兼容

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