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[新手求助] 激发态结构振动频率计算慢正常吗?

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荧光光谱计算,运行到激发态振动频率计算这一步(高斯手册第五步),30个左右的原子,16个核CPU(3.2主频)算了两周,显示还在计算,这正常吗?太慢了。谢谢!
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

%oldchk=04-ac%chk=05-ac
# B3LYP/6-31G(d,p) TD=(Read,NStates=6,Root=1) Freq  
   SCRF=(Solvent=water) Geom=Check Guess=Read NF excited state freq

0 1
。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-7 17:00:54 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-7 16:39
不考虑非平衡溶剂可能会有数量级在0~0.2eV左右的误差,问题不大。也不一定考虑了非平衡溶剂效应就更准, ...

谢谢卢老师,高斯的说明书关于荧光光谱的计算误导了不少初学者。经你这么一指点,原来计算发射谱两步就能搞定。谢谢!

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发表于 Post on 2015-7-7 16:39:05 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-7-7 16:10
谢谢卢老师,谈到这里,不免我还想请教一下,如果考虑荧光过程的非平衡溶剂效应,应该怎么设置呢?分几步 ...

不考虑非平衡溶剂可能会有数量级在0~0.2eV左右的误差,问题不大。也不一定考虑了非平衡溶剂效应就更准,因为有时候有误差抵消。

我前面给出的过程是两步。要考虑非平衡溶剂,那就把手册里的6、7步加到最后,一共四步。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-7 16:10:08 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-6 21:38


如果再考虑荧光过程的非平衡溶剂效应会更准一些,但要稍微啰嗦点。

谢谢卢老师,谈到这里,不免我还想请教一下,如果考虑荧光过程的非平衡溶剂效应,应该怎么设置呢?分几步?如果不考虑的话,上述计算方式一般能否被接受。

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发表于 Post on 2015-7-7 15:09:16 | 只看该作者 Only view this author
来学习下!!

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发表于 Post on 2015-7-6 21:38:02 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-7-6 17:25
谢谢卢老师,你这修改的应该是用TDDFT计算荧光发射、同时考虑到溶剂效应、2步计算完成的书写方式吧?



如果再考虑荧光过程的非平衡溶剂效应会更准一些,但要稍微啰嗦点。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-6 17:25:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-6 17:17
CIS比TDDFT差得远,算荧光应当用TDDFT

第一步:

谢谢卢老师,你这修改的应该是用TDDFT计算荧光发射、同时考虑到溶剂效应、2步计算完成的书写方式吧?

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发表于 Post on 2015-7-6 17:17:46 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-7-6 17:08
刚才我改了(9楼),请看看错在什么地方,不好意思我从来没有算过这个荧光发射


CIS比TDDFT差得远,算荧光应当用TDDFT

第一步:
%nprocshared=20
%mem=55GB
%chk=2NF.chk
# Opt B3LYP/6-31G** scrf

2NF1 ground state

2 1
C                 -8.35184600   -4.37086300   -2.04627200
N                 -9.69511900   -4.09121800   -1.53104700
C                 -9.95150800   -2.64930000   -1.52529000
C                 -8.94078600   -1.94531700   -0.61971000
N                 -7.57146100   -2.24232700   -1.06487500
C                 -7.31522600   -3.69885900   -1.15142700
... ...

第二步:
%nprocshared=20
%mem=55GB
%chk=2NF.chk
# Opt B3LYP/6-31G** TD SCRF Geom=Check Guess=Read

2NF2

2 1

直接取最后一步的第一激发能和振子强度即可。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-6 17:08:15 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lao7 于 2015-7-6 17:15 编辑
sobereva 发表于 2015-7-6 17:06
不要管高斯手册。很多人老是提高斯手册里的那个啰嗦复杂的例子。那个例子之所以啰嗦,是因为从吸收到发 ...

刚才我改了(9楼),请看看错在什么地方,不好意思我从来没有算过这个荧光发射

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发表于 Post on 2015-7-6 17:06:22 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-7-6 17:03
谢谢!总共两步吗?为什么高斯手册上计算荧光光谱用了7步呢。

根据你的意见,请看看我这样写分子坐标 ...


不要管高斯手册。很多人老是提高斯手册里的那个啰嗦复杂的例子。那个例子之所以啰嗦,是因为从吸收到发射都事无巨细完整算了一遍,还考虑了非平衡溶剂。

你写得不对,就按我说的写就完事了。顶多再写上scrf关键词考虑水溶剂就得了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-6 17:03:56 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lao7 于 2015-7-6 17:06 编辑
sobereva 发表于 2015-7-6 15:21
非常简单
1 优化基态HF/6-31G* opt
2 用第1步结构做初猜优化激发态(如S1)  CIS/6-31G* opt

谢谢!总共两步吗?为什么高斯手册上计算荧光光谱用了7步呢。

根据你的意见,请看看我这样写分子坐标是否合理?谢谢。

第一步:
%nprocshared=20
%mem=55GB
%chk=2NF1.chk
# Opt Freq HF/6-31G** scrf=(solvent=water,pcm)

2NF1 ground state

2 1
C                 -8.35184600   -4.37086300   -2.04627200
N                 -9.69511900   -4.09121800   -1.53104700
C                 -9.95150800   -2.64930000   -1.52529000
C                 -8.94078600   -1.94531700   -0.61971000
N                 -7.57146100   -2.24232700   -1.06487500
C                 -7.31522600   -3.69885900   -1.15142700
... ...

第二步:
%nprocshared=20
%mem=55GB
%oldchk=2NF1
%chk=2NF2
# Opt Freq CIS/6-31G** TD=NStates=6 SCRF=(Solvent=water)
  Geom=Check Guess=Read

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发表于 Post on 2015-7-6 15:21:52 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-7-6 14:22
好 谢谢!请问哪里能找到gaussian用CIS计算发射光谱的例子?能否把以前高斯说明书中的TDDFT的例子直接拿回 ...

非常简单
1 优化基态HF/6-31G* opt
2 用第1步结构做初猜优化激发态(如S1)  CIS/6-31G* opt
最后一步输出的第一激发能就是荧光发射能。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-6 14:22:16 | 只看该作者 Only view this author
好 谢谢!请问哪里能找到gaussian用CIS计算发射光谱的例子?能否把以前高斯说明书中的TDDFT的例子直接拿回来,基组换一下使用,其他不变?谢谢

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发表于 Post on 2015-6-29 17:48:02 | 只看该作者 Only view this author
lao7 发表于 2015-6-29 17:40
Gaussian对于CIS支持解析Hessian,请问如此计算的精度咋样?对于强度精度无要求,只要求波长精度高些即可 ...

CIS计算激发能总会偏高,但不意味着CIS的激发态势能面形状很不合理,用CIS算激发态振动还是可以的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-29 17:40:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-5 13:58
常见量化程序中支持TDDFT解析Hessian的只有Q-Chem
Gaussian对于CIS支持解析Hessian,也可以考虑

Gaussian对于CIS支持解析Hessian,请问如此计算的精度咋样?对于强度精度无要求,只要求波长精度高些即可。

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