tinker中mm3力场minimize计算有机分子的最低能量

wanglimei · 发表于 Post on 2019-2-26 13:13:56

老师：
您好！请教一下用tinker中mm3力场计算有机分子最小能量（minimize）时，由于有机分子中含有吡咯环并且吡咯氮上面连有乙基，所以在计算时会显示angle bending parameters 和Torsional parameters undefined，如图所示，请教老师这种问题需要怎么处理，谢谢老师！

k64_cc · 发表于 Post on 2019-2-27 12:19:41

本帖最后由 k64_cc 于 2019-2-27 12:21 编辑

先弄清楚你缺啥参数再说，真的不想赋这个参数可以把系数填成0，不贡献能量。

不过都用tinker了为啥还用mm3，amoeba不好用吗？

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