用packmol可以生成斜盒子吗？

万年流星 · 发表于 Post on 2019-4-30 10:14:51

用packmol生成均相混合体系，由于加入的晶体为斜的，所以想做个斜盒子，请问各位大神怎么实现呐？

shgpei · 发表于 Post on 2019-7-8 10:56:12

用packmol导入晶面.pdb不会直接把晶面当成一个大分子吗？感觉packmol 构建带晶面的初始结构不可行

万年流星 · 发表于 Post on 2019-5-15 08:54:37

sobereva 发表于 2019-5-14 20:22
保存文件时恰当使用选择语句设定选区。语法看VMD手册

Thank you

sobereva · 发表于 Post on 2019-5-14 20:22:43

万年流星发表于 2019-5-14 15:50
老师怎么用VMD切割呐？

保存文件时恰当使用选择语句设定选区。语法看VMD手册

万年流星 · 发表于 Post on 2019-5-14 15:50:12

sobereva 发表于 2019-4-30 11:25
packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

老师怎么用VMD切割呐？

万年流星 · 发表于 Post on 2019-4-30 15:43:46

sobereva 发表于 2019-4-30 11:25
packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

谢谢sob老师

sobereva · 发表于 Post on 2019-4-30 11:25:41

packmol直接实现不了，只能之后自行用比如VMD切割

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