计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 12826|回复 Reply: 6
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 求助,刚性扫面出问题

[复制链接 Copy URL]

53

帖子

0

威望

458

eV
积分
511

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
我想变化分子的两个二面角,其他结构信息不进行更改,看看,随着这两个二面角进行更动,相应的跃迁能以及振子强度如何变化。但是总是出错,以下是我的部分输入文件:
%chk=cam_c2v_scan.chk
%mem=900MW
#p  cam-b3lyp/6-31g**  scan nosymm   td(nstates=6,NonEqSolv)  scrf=(solvent=n,n-DiMethylFormamide,pcm)

carbazole_s 6311gdp thf

0 1
C
C                  1            B1
C                  2            B2    1            A1
C                  3            B3    2            A2    1            D1    0
C                  4            B4    3            A3    2            D2    0
C                  3            B5    2            A4    1            D3    0
.............

   D42          180.00000000 8 30.0
   D43            0.00000000
   D44          180.00000000
   D45          180.00000000
   D46          180.00000000
   D47          180.00000000
   D48          180.00000000
   D49          180.00000000
   D50          180.00000000

.......
输出文件提示如下:
Initial guess read from the read-write file.
B after Tr=     0.000000    0.000000    0.000000
         Rot=    1.000000    0.000000    0.000000    0.000000 Ang=   0.00 deg.
Guess basis will be translated and rotated to current coordinates.
Generating alternative initial guess.
Harris functional with IExCor=20419 diagonalized for initial guess.
ExpMin= 1.61D-01 ExpMax= 4.17D+03 ExpMxC= 6.27D+02 IAcc=1 IRadAn=         1 AccDes= 0.00D+00
HarFok:  IExCor=20419 AccDes= 0.00D+00 IRadAn=         1 IDoV= 1
ScaDFX=  1.000000  1.000000  1.000000  1.000000
Spurious integrated density or basis function:
NE=  312 NElCor=    0 El error=5.54D-02 rel=1.78D-04 Tolerance=1.00D-03
Shell   173     absolute error=1.23D-02              Tolerance=1.20D-02
Shell   155       signed error=2.70D-04              Tolerance=1.00D-01
Inaccurate quadrature in CalDSu.
Error termination via Lnk1e in /global/apps/gaussian/09.c01/linda-exe/../l401.exel at Mon Jun 22 09:47:54 2015.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes 58.5 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=   5964 Int=      0 D2E=      0 Chk=    574 Scr=      1
failed to open execfile
(END)

求助,这种情况该如何解决,拜托大家


cam_c2v_scan.inp

10.91 KB, 下载次数 Times of downloads: 3

cam_c2v_scan.log

182.82 KB, 下载次数 Times of downloads: 1

cam_c2v_scan.out

4.71 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

53

帖子

0

威望

458

eV
积分
511

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-1 10:46:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-1 09:13
你的扫描设置的并不合理,比如用gview打开,查看第53步,两个氮原子都挨在一起了。
怎么分析、处理数据, ...

老师,D42以及D41规定了同一个二面角,我想扫描一下这个二面角,我如果只设定D42每30度扫描一下,D41不进行设定,这样的话会导致两个N原子挨到一起,我如果把D41后面对应的角度去掉或者直接去掉D41,进行D42每30度扫描都会出错,真不知道该怎么办,求指教

53

帖子

0

威望

458

eV
积分
511

Level 4 (黑子)

6#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-1 09:41:18 | 只看该作者 Only view this author
确实是这样的,谢谢老师,老师我想看看两个邻二氮杂菲分别于中间的咔唑所构成的两个二面角进行变化,其他结构信息不进行更改,看看,随着这两个二面角进行更动,相应的跃迁能以及振子强度如何变化。
D12是其中一个二面角,但是我发现,D42以及D41描述了同一个二面角,因为我要看两个邻二氮杂菲分别于中间的咔唑所构成的两个二面角的变化,所有就设定让D12以及D42进行变化,其他不变,是不是因为D41和D42是描述了相同的二面角最终导致第53步的两个N挨一起了。
老师真的是不知道该怎么设定了,麻烦老师给看一下,不胜感激。我将输入文件也放到附件中了,多谢老师。

cam_c2v_scan.inp

11 KB, 下载次数 Times of downloads: 0

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

5#
发表于 Post on 2015-7-1 09:13:06 | 只看该作者 Only view this author
你的扫描设置的并不合理,比如用gview打开,查看第53步,两个氮原子都挨在一起了。
怎么分析、处理数据,要看你的扫描目的
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

53

帖子

0

威望

458

eV
积分
511

Level 4 (黑子)

4#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-1 08:50:26 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 幸运兔 于 2015-7-1 09:02 编辑
sobereva 发表于 2015-6-23 09:16
写上scf=novaracc,如果还不行,再写上int=ultrafine

sob老师,根据您的建议,终于扫描成功了,谢谢老师,但是不知道该怎么处理数据,请老师给些提示。不胜感激

cam_c2v_scan.out

4.06 MB, 下载次数 Times of downloads: 3

53

帖子

0

威望

458

eV
积分
511

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-6-23 09:21:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-6-23 09:16
写上scf=novaracc,如果还不行,再写上int=ultrafine


谢谢老师

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112353

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2015-6-23 09:16:24 | 只看该作者 Only view this author
写上scf=novaracc,如果还不行,再写上int=ultrafine
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 21:01 , Processed in 0.178955 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list