计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9180|回复 Reply: 10
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 几何优化后计算频率的几个问题

[复制链接 Copy URL]

114

帖子

0

威望

481

eV
积分
595

Level 4 (黑子)

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
大家好:
  今天在gaussian官网找到“Vibrational Analysis in Gaussian”这篇文献,有这样两个问题:
  1:文献里面强调与转动模式相应的三个频率应该趋于0,这个原因我好像在帖子里见过,不知是否能分享一下这篇文章,或解释一下。
  2:文献还提到,基于不同方法计算的频率,对于趋于0的程度不同,如DFT应该低于50左右,我发现我照着最近一文献采用m062x/6-311+G(2df,2p)优化的结果,排第三的频率已经上百,请问这个标准是严格的吗?
  谢谢大家!

1043

帖子

0

威望

4106

eV
积分
5149

Level 6 (一方通行)

11#
发表于 Post on 2020-6-21 13:06:47 | 只看该作者 Only view this author
雨做的云 发表于 2020-6-17 20:54
你好,我想问一下这两行低频频率中的第一行六个是对应转动,第二行的三个是对应平动吗

不是的。第一行六个对应的是三个平动和三个转动,第二行的三个是指所有振动频率中最低的三个

10

帖子

0

威望

334

eV
积分
344

Level 3 能力者

10#
发表于 Post on 2020-6-19 15:38:19 | 只看该作者 Only view this author

好的,谢谢!

1043

帖子

0

威望

4106

eV
积分
5149

Level 6 (一方通行)

9#
发表于 Post on 2020-6-19 15:25:38 | 只看该作者 Only view this author
雨做的云 发表于 2020-6-17 20:54
你好,我想问一下这两行低频频率中的第一行六个是对应转动,第二行的三个是对应平动吗

是的

10

帖子

0

威望

334

eV
积分
344

Level 3 能力者

8#
发表于 Post on 2020-6-17 20:54:54 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-20 21:35
看来确实是你看错了。gview只显示振动频率。对于平动和转动的所谓low frequencies得在out文件里找,高斯 ...

你好,我想问一下这两行低频频率中的第一行六个是对应转动,第二行的三个是对应平动吗

114

帖子

0

威望

481

eV
积分
595

Level 4 (黑子)

7#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-21 08:37:35 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-5-21 01:34
1 分子整体平动和转动没有任何回复力。所以如果你做了充分几何优化,自然平动和转动频率就应当十分接近0

...

谢谢老师!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2019-5-21 01:34:29 | 只看该作者 Only view this author
1 分子整体平动和转动没有任何回复力。所以如果你做了充分几何优化,自然平动和转动频率就应当十分接近0

2 “如DFT应该低于50左右”这种说法没有任何意义,连泛函都没说。仔细看下文了解基础知识
谈谈谐振频率校正因子
http://sobereva.com/221
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

114

帖子

0

威望

481

eV
积分
595

Level 4 (黑子)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-20 22:46:25 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-20 21:35
看来确实是你看错了。gview只显示振动频率。对于平动和转动的所谓low frequencies得在out文件里找,高斯 ...

非常感谢,我确实理解错了,打开输出文件有两行Low frequencies,这个数值是符合的,谢谢您!

1043

帖子

0

威望

4106

eV
积分
5149

Level 6 (一方通行)

4#
发表于 Post on 2019-5-20 21:35:56 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
jing-quan63 发表于 2019-5-20 21:11
谢谢!只是频率不是在gview里就能看吗?我就是看的gview里的前三个频率

看来确实是你看错了。gview只显示振动频率。对于平动和转动的所谓low frequencies得在out文件里找,高斯会给出一个9个low frequencies,你得找前6个(对于非线型多原子分子)低频,这才是对应平动和转动的

114

帖子

0

威望

481

eV
积分
595

Level 4 (黑子)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-5-20 21:11:23 | 只看该作者 Only view this author
granvia 发表于 2019-5-20 20:52
1. 因为只有振动对应的Hessian矩阵本征值不为零(即能量二阶导数,相当于谐振子的力常数)

2. 看上去不 ...

谢谢!只是频率不是在gview里就能看吗?我就是看的gview里的前三个频率

1043

帖子

0

威望

4106

eV
积分
5149

Level 6 (一方通行)

2#
发表于 Post on 2019-5-20 20:52:56 来自手机 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 granvia 于 2019-5-20 20:54 编辑

1. 因为只有振动对应的Hessian矩阵本征值不为零(即能量二阶导数,相当于谐振子的力常数)

2. 看上去不太可能吧,是否out文件看串行了。也可试试opt=tight或verytight,但不保证能改进

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-23 23:20 , Processed in 0.164451 second(s), 22 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list