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[综合交流] 加入弥散函数会对RESP电荷造成不利影响吗?

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出于跑分子动力学的目的,计算了如图所示的分子的RESP电荷,在B3LYP-D3/def2svp优化后分别用图示的三个等级算单点,然后用Multiwfn计算RESP电荷,发现6-311G(d,p)加上弥散后,醚氧的负电荷增加很多,都比酯基氧的还大了,def2-TZVP也有这样的趋势,但不如6-311+G(d,p)明显。这就让我很疑惑,按我的理解,对这种不带负电荷的体系计算RESP电荷,加不加弥散应该结果差不多才对,但结果却差距很大。请问加弥散会对RESP电荷计算带来什么不利影响吗,在这种情况下,我应不应该带上弥散来计算RESP电荷呢?

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计算RESP电荷

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发表于 Post on 2019-9-10 20:35:20 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-10 06:41
没,就是用几个简单体系做的测试,还不足以构成一篇文章
以后是有打算写成文章,不仅讨论对拟合静电势电 ...

謝謝sob老師,希望可以看到文章儘早面世。

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发表于 Post on 2019-9-10 06:41:29 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2019-9-9 19:01
谢谢sob老师,不知道老师有计划公开这些数据吗?比如在预印本之类的地方?

没,就是用几个简单体系做的测试,还不足以构成一篇文章
以后是有打算写成文章,不仅讨论对拟合静电势电荷的影响,还讨论对Multiwfn做的静电势的定量分子表面分析的那些量的影响,筛出几个最划算的算静电势相关问题的基组
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-9-9 19:01:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-9-9 18:41
之前我做过专门的基组对静电势影响的测试,测试了一批基组,没有发表而已

谢谢sob老师,不知道老师有计划公开这些数据吗?比如在预印本之类的地方?

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发表于 Post on 2019-9-9 18:41:23 | 只看该作者 Only view this author
wuzhiyi 发表于 2019-9-9 18:26
请问sob老师,我最近也在研究弥散对RESP的影响,感觉对我的系统我的结果也和您说的类似

6-311+G**和6- ...

之前我做过专门的基组对静电势影响的测试,测试了一批基组,没有发表而已
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发表于 Post on 2019-9-9 18:26:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-7-3 22:00
由于6-311G**还不是很大,对价电子分布描述还不算特别充分,所以弥散函数对范德华表面外静电势分布还是会有 ...

请问sob老师,我最近也在研究弥散对RESP的影响,感觉对我的系统我的结果也和您说的类似

6-311+G**和6-311G**有一定差别

但ma-TZVP和def2-TZVP差别不大

但想问一下您这个结论是如何得到的呢?我自己查发现做这类benchmark的RESP文献里没看看,在[原子电荷计算方法的对比]里也没有对于弥散对于RESP的影响,想问一下sob老师有啥推荐的文献讨论了弥撒对RESP的影响。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-7-5 09:11:27 | 只看该作者 Only view this author
谢谢社长,尝试了ma-TZVP,结果确实如此。但我还有一点疑问,从multiwfn计算出的静电势极小值点的数值看(如下图),三个等级计算出值非常接近,而且羰基氧上的数值明显负于醚基氧,而计算出的这两种O的RESP电荷却因基组不同而相对大小都变化了。因为我是用MD研究聚合物电解质中羰基和醚基对Li离子的配位情况,两者相对配位能力的大小对计算结果非常重要。请问6-311+G(d,p)算出来醚基氧原子电荷反比羰基氧更负的情况合理吗?
@sobereva

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发表于 Post on 2019-7-3 22:00:55 | 只看该作者 Only view this author
由于6-311G**还不是很大,对价电子分布描述还不算特别充分,所以弥散函数对范德华表面外静电势分布还是会有可查觉的影响的,进而影响拟合静电势电荷。

如果你对比ma-TZVP(带最低程度弥散的def2-TZVPP)和def2-TZVP,你应当会发现结果差异不会那么大。而如果你去对比比如ma-QZVP和def2-QZVP,那差异就微乎其微了。

带弥散函数只会改进拟合静电势电荷计算结果,而不会带来任何不利影响。只不过如果本身基组已经质量挺高了,那么再加弥散函数就没必要了。
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