计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 8320|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[新手求助] 关于含赝势的分子wfn输出文件格式问题

[复制链接 Copy URL]

10

帖子

0

威望

334

eV
积分
344

Level 3 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
起因由于在用相关软件读取gaussian输出的wfn文件时,发现读取错误。

究其原因,发现我这个含Pd的分子的wfn输出文件是这样一个格式:

在一堆centre assignmnets, type assignments 和 Exponents之后,MO之前。

还有几个centre assignmnets, type assignments 和 Exponents之类的数据,如下所示(因文件太大,就截取一段)。

……
EXPONENTS  0.3272304D+00 0.1030724D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00
EXPONENTS  0.3406134D+02 0.5123575D+01 0.1164663D+01 0.3272304D+00 0.1030724D+00
EXPONENTS  0.8000000D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00 0.3406134D+02 0.5123575D+01
EXPONENTS  0.1164663D+01 0.3272304D+00 0.1030724D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00
EXPONENTS  0.8000000D+00 0.3406134D+02 0.5123575D+01 0.1164663D+01 0.3272304D+00
EXPONENTS  0.1030724D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00 0.8000000D+00
CENTRE ASSIGNMENTS   22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22 22
CENTRE ASSIGNMENTS   22 22 22 22 22
TYPE ASSIGNMENTS      1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1  1
TYPE ASSIGNMENTS      1  1  1  1  1
EXPONENTS  0.4459566D+08 0.2277439D+08 0.1163057D+08 0.5939569D+07 0.3033256D+07
EXPONENTS  0.1549042D+07 0.7910743D+06 0.4039907D+06 0.2063125D+06 0.1053609D+06
EXPONENTS  0.5380637D+05 0.2747817D+05 0.1403272D+05 0.7166317D+04 0.3659739D+04
EXPONENTS  0.1868978D+04 0.9544614D+03 0.4874302D+03 0.2489239D+03 0.1271220D+03
EXPONENTS  0.6491944D+02 0.3315346D+02 0.1693102D+02 0.8646436D+01 0.2254994D+01
MO    1     MO 0.0        OCC NO =    2.0000000  ORB. ENERGY =  -77.353055
  0.20317665D-06  0.37920772D-06  0.64720622D-06  0.10058231D-05  0.13472289D-05
  0.13838959D-05 -0.16330708D-05 -0.48392617D-06 -0.77666372D-04  0.45668736D-03
  0.92570547D-03 -0.34574864D-05 -0.36903999D-05 -0.32318248D-05 -0.20408571D-05
-0.71645728D-05 -0.76472141D-05 -0.66969588D-05 -0.42290460D-05 -0.11426885D-04

……

22是我的Pd原子,我在查完basissetexchange之后发现Pd原子的高斯型函数已经在前面一堆centre assignmnets, type assignments 和 Exponents之中都有了,而且相应的PRIMITIVES数量也都对的上。

不知道这几个多出来的几行是什么意思,删去之后可以正确运行相关软件并读入该wfn文件。希望大佬解惑!

10

帖子

0

威望

334

eV
积分
344

Level 3 能力者

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-8-27 14:27:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-8-20 22:11
估计是EDF字段,原本是wfx文件里才有的,现在可能在wfn文件里也有了。EDF字段在这里有说明
在赝势下做波函 ...

感谢sob老师!

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125169

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-8-20 22:11:10 | 只看该作者 Only view this author
估计是EDF字段,原本是wfx文件里才有的,现在可能在wfn文件里也有了。EDF字段在这里有说明
在赝势下做波函数分析的一些说明
http://sobereva.com/156

可以用Multiwfn载入fch文件,用主功能100的子功能2导出成wfn文件,就没有这部分了。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-25 06:42 , Processed in 0.150250 second(s), 21 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list