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[辅助/分析程序] 求助Polyrate 2015的安装

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Sob老师曾经推荐过Win平台下计算Rate Constant的软件Kistelp,简单易用,但是我想将计算结果和Polyrate比较下,我个人觉得两款软件的主要差别可能在于tunnelling的修正。

polyrate是从其官网,通过申请得到的,还是比较方便的,版本是最新的2015。我的操作系统是ubuntu kylin 15.04的,按照Manual进行解压,./configure。产生的是RP-VTST的makefile。找到编译器是GNU fortran compiler、MPI compiler、GNU C compiler 以及 MPI C compiler,最后显示Makefile 正常安装。 在polyrate2015/usr 下面,我检查了下Makefile, 有flag -fno-automatic的显示。

但是运行 textrun的时候遇到错误:
gmake: command not found
我搜索了下,网上说应该用 make 取代 gmake, 采用命令 sudo ln -s /usr/bin/make /usr/bin/gmake
但是运行完后出现 gmake -s // gmake[1]: C:命令为找到...CP:无法获取“poly.000/poly.fu6”的文件状态(stat):没有那个文件或目录

想请教大家介绍下安装经验或者有什么办法解决这个错误

谢谢~~~~~

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发表于 Post on 2024-1-7 18:21:42 | 只看该作者 Only view this author
adminer 发表于 2024-1-5 16:42
这个要怎么解决呢,

这个我真不记得了,我印象中我好像是在定义内坐标的时候报的这个错,然后我就把Polyrate目录里面带的算例的格式复制过去,然后把里面的数值修改,然后就好了。这个报错你可以对应到你输入具体啥地方错了,然后去找算例对应部分的格式,复制然后修改里面的数值。另外,编译的时候最好用intel编译器,编译器的版本的和种类也会有影响。

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发表于 Post on 2024-1-5 16:42:50 | 只看该作者 Only view this author
qiqi7 发表于 2021-12-30 12:14
谢谢您,我已经解决了,是格式问题

这个要怎么解决呢,

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发表于 Post on 2024-1-5 16:41:13 | 只看该作者 Only view this author
qiqi7 发表于 2024-1-5 10:53
好久没用过gaussrate了,我记得是格式问题,后面我基于他给的算例进行修改,严格保持格式一致就OK了

是算例的格式问题吗,方便的话能不能把你以前计算的例子发我一份呀,2263393795@qq.com

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发表于 Post on 2024-1-5 10:53:00 | 只看该作者 Only view this author
adminer 发表于 2024-1-5 10:17
这个问题你解决了吗,我也是有这样子的

好久没用过gaussrate了,我记得是格式问题,后面我基于他给的算例进行修改,严格保持格式一致就OK了

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发表于 Post on 2024-1-5 10:17:11 | 只看该作者 Only view this author
qiqi7 发表于 2021-10-18 15:00
请问您使用gaussrate的时候有类似于  ERROR: illegal digit in an integer:          5 这样的报错吗?这个提示有 ...

这个问题你解决了吗,我也是有这样子的

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发表于 Post on 2024-1-5 10:15:05 | 只看该作者 Only view this author
VRC版本的安装会有很多警告polyrate:C:\Users\administor\Desktop\polyrate.png,gaussrate:C:\Users\administor\Desktop\gaussrate.png,intel编译器我用的19.Fortran 是18,会是编译器的问题吗,运行测试用例也不行,任务都提交不上,报了mv: cannot stat 'poly.fu6': No such file or directory“的问题,需要怎么解决呢

polyrate.png (105.73 KB, 下载次数 Times of downloads: 32)

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gaussrate.png (85.62 KB, 下载次数 Times of downloads: 27)

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发表于 Post on 2022-10-8 21:21:54 | 只看该作者 Only view this author
younggood 发表于 2022-10-8 17:36
您好,我现在有个问题是,安装完Gaussrate后,guassrate.exe没有出现在polyrate解压后的exe文件夹里,我 ...

安装的有点久了,试着回复一下,我在官网申请的Polyrate版本是polyrate17C_20190728_withSSQRRK_20190110.tar.gz,申请的gaussrate版本是gaussrate17-B_20170808.tar.gz,把gaussrate压缩到了polyrate解压后的文件里,这样就包含在内了,希望对你有帮助

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发表于 Post on 2022-10-8 17:36:31 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-6-3 22:23
没有等到各位老师们的回复,问题已经解决啦,自问自答一下
1.安装的时候gaussrate应该放到polyrate ...

您好,我现在有个问题是,安装完Gaussrate后,guassrate.exe没有出现在polyrate解压后的exe文件夹里,我试了很多次,那个exe文件夹只有shuttle,万分感谢!

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发表于 Post on 2021-12-30 12:14:11 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-12-21 10:28
遇到过,好像是数字格式设置的有问题会报错

谢谢您,我已经解决了,是格式问题

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发表于 Post on 2021-12-21 10:29:09 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-12-21 10:28
遇到过,好像是数字格式设置的有问题会报错

没有太注意,感觉不超过一周吧

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发表于 Post on 2021-12-21 10:28:35 | 只看该作者 Only view this author
qiqi7 发表于 2021-10-18 15:00
请问您使用gaussrate的时候有类似于  ERROR: illegal digit in an integer:          5 这样的报错吗?这个提示有 ...

遇到过,好像是数字格式设置的有问题会报错

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发表于 Post on 2021-12-20 14:24:36 | 只看该作者 Only view this author
hhwang 发表于 2021-6-3 22:23
没有等到各位老师们的回复,问题已经解决啦,自问自答一下
1.安装的时候gaussrate应该放到polyrate ...

您好,请问POLYRATE申请后一般多久会有回复呢?

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发表于 Post on 2021-12-20 14:22:59 | 只看该作者 Only view this author
福建会 发表于 2016-4-14 21:10
**** 作者被禁止或删除 内容自动屏蔽 ****

请问POLYRATE申请后一般多久会有回复呢?

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发表于 Post on 2021-12-16 11:04:36 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-4-14 20:52
到这里免费申请就行了,很简单
http://comp.chem.umn.edu/polyrate/

求问,申请后一般多久能达到使用权限?

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