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[GROMACS] 计算自由能出现非键相互作用超过表格限制问题

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Level 5 (御坂)

我需要计算有机阴离子的溶解自由能,使用的是gaff力场,使用的top,mdp设置如图和附件所示。也使用了软核势能,总是出现Warning,提示非键相互作用超过表格限制的问题,虽然也可以继续往下跑,请问这样会有很大问题么?是什么原因导致的,怎么解决?


1.png (48.56 KB, 下载次数 Times of downloads: 19)

1.png

topol.top

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topol

nvt.00.mdp

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mdp

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Level 4 (黑子)

2#
发表于 Post on 2020-3-1 17:22:42 | 只看该作者 Only view this author
请问楼主解决了吗?我也遇到了这样的问题

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