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[配置讨论] 请教小规模服务器集群的准系统、cpu、网络等应该如何配置

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本帖最后由 mgqqlwq 于 2019-10-29 16:00 编辑

最近跟老板申请购买计算服务器,老板让我们先调研。我们之前有一个18核的机架式和机架,所以我们初步打算再买两到三台机器组建一个小的集群,当然最后还要考虑价格和老板支持的力度。
之前不懂服务器,看了卢老师关于配置机器的帖子,学到非常非常多,也发现我们之前那台机器估计被坑惨了。因为我们想组小集群,配置上有些地方和组单机似乎不一样,心里没底,所以想跟大家请教下集群配置方面的问题。
1. 我目前主要用的软件是LAMMPS,组里还有其他人用有限元和蒙特卡洛方面的软件,论坛上讨论配机的似乎涉及到Gromacs多一些,请问LAMMPS的话GPU加速的效果怎样呢?因为有限元和蒙特卡洛方面的应该用不到GPU,我们目前考虑还是优先CPU,再酌情增加GPU,这样考虑是否合理呢?
2. 准系统目前有个商家推荐的是超微的7049A-T,淘宝上能查到的非常少,淘宝上超微能找到的还有7049GP-TRT和其他型号的准系统,似乎型号也不少,请问如果用6系或者8CPU的话选择超微哪款准系统好一些?另外准系统是建议选择超微的还是Dell R740之类的呢?或者应该像卢老师帖子里那样主板机箱单卖组装更好一些?但我们想要放在机架上,还是需要找机架式的那种。
3. CPU目前一个商家推荐的是6148CPU,价格8000多,8173M价格12000-13000的话和6148选那个更合适一些?还有其他商家推荐623062488260等,请问下6系和8CPU选择那个型号好一些?在网上两两比较CPU参数感觉都差不多,确实有些看不懂。CPU是不是还是应该选卢老师推荐的8173M
4. 另外CPU 基准频率(Base Frequency)和睿频(Turbo Frequency)选择时到底应该参考那个选择?做计算的时候一般CPU是运行在那个频率上?对这块有点傻傻分不清。
5. 内存选择12*16GB是为了把通道填满,发挥CPU最大的性能是吗?
6. 请问组集群就一定需要用IB交换机和网卡对吧,必须要那种100G的吗?这个价格比较贵,还有个商家推荐OPA的卡和交换机,对这块自己了解就更少了,请问下大家应该怎么考虑网络的部分。
7. 如果网路部分太贵,导致费用太高,我们准系统选择四路CPU的机器推荐吗?四路CPU的和两路的比有什么优缺点呢?论坛上好像没有推荐4路的,是因为性价比太低了吗?


另外求教一下大家,zf采购网的价格都好贵,怎样才能规避这个天坑呢?tb性价比高怎样才能买到呢?单位这块不好过关。
问题有点多,还请大家不吝赐教多多帮助。如果有其他没有考虑到的问题,也欢迎多多指点。
先谢过大家了!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-23 08:32:38 | 只看该作者 Only view this author
xiaxue 发表于 2019-11-22 23:02
找的淘宝上的,直接给整机价格,应该是比6173低3000的样子。

了解了,谢谢分享!

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发表于 Post on 2019-11-22 23:02:13 | 只看该作者 Only view this author
找的淘宝上的,直接给整机价格,应该是比6173低3000的样子。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-22 17:19:26 | 只看该作者 Only view this author
xiaxue 发表于 2019-11-21 20:01
8136用超微的主板就可以,不过需要刷bios。
最近帮别人配了一台,刚到货,希望不要翻车。

8136您买的大概多少钱呢?

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发表于 Post on 2019-11-21 20:01:43 | 只看该作者 Only view this author
monoyu 发表于 2019-11-1 21:48
请问是配永擎的主板么?

8136用超微的主板就可以,不过需要刷bios。
最近帮别人配了一台,刚到货,希望不要翻车。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-17 23:29:03 | 只看该作者 Only view this author

明白了,非常非常感谢卢老师!

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发表于 Post on 2019-11-16 13:10:17 | 只看该作者 Only view this author
mgqqlwq 发表于 2019-11-15 08:47
我们目前主要跑分子动力学和有限元的计算,以后也许会跑第一性原理的一些计算。好像LAMMPS并行效率还挺好 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-15 08:47:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-15 00:30
半斤八两,看程序以及具体跑的任务的并行效率

我们目前主要跑分子动力学和有限元的计算,以后也许会跑第一性原理的一些计算。好像LAMMPS并行效率还挺好的,像我们这种情况选这两个都差不多是吧?

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发表于 Post on 2019-11-15 00:30:02 | 只看该作者 Only view this author
mgqqlwq 发表于 2019-11-14 16:38
好的,谢谢卢老师!
这么说的话8270性能还是比8173M好一些?

半斤八两,看程序以及具体跑的任务的并行效率
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-14 16:38:30 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-13 22:00
只要对方承诺不是工程版就行

好的,谢谢卢老师!
这么说的话8270性能还是比8173M好一些?

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发表于 Post on 2019-11-13 22:00:21 | 只看该作者 Only view this author
mgqqlwq 发表于 2019-11-13 18:06
谢谢卢老师!前几天论坛登陆不上来,回复晚了。
我们目前可能需要从大一点的厂家买,他们不能卖8136之类 ...

只要对方承诺不是工程版就行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-13 18:06:41 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-5 09:25
挑不挑主板,卖CPU的商家大多会注明
8173M这种型号不挑主板,和ARK上能查到的正式版完全一样
8136不能 ...

谢谢卢老师!前几天论坛登陆不上来,回复晚了。
我们目前可能需要从大一点的厂家买,他们不能卖8136之类的U。
有个厂家推荐8270的cpu,但是最后价格和8173M差不多,但是我查8270应该贵很多才对。
想请教一下您,(1) 这种会不会有什么问题,不明白他便宜的原因是什么;(2) 8270的性能和8173M比怎么样呢?我看8270是26个核

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发表于 Post on 2019-11-5 09:25:17 | 只看该作者 Only view this author
mgqqlwq 发表于 2019-11-5 08:58
卢老师,我从INTEL ARK上查询的话,8173M和8136都不在列表里面?
是不是说8173M也是一样的问题,但是使 ...

挑不挑主板,卖CPU的商家大多会注明
8173M这种型号不挑主板,和ARK上能查到的正式版完全一样
8136不能说“问题大”,用起来并不会有任何问题,只能说可能只兼容某些主板,或者一些主板需要刷BIOS才能支持。向卖家咨询即可。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-5 08:58:22 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-5 08:36
有些不在Intel ARK里能查到的CPU挑主板

由于之前有些用户滥发垃圾广告,被封了IP。但你的情况未必是这 ...

卢老师,我从INTEL ARK上查询的话,8173M和8136都不在列表里面?
是不是说8173M也是一样的问题,但是使用的人多很多,所以出问题的可能性很小。8136之前很少有人用过,出问题的可能性就大一些?

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mgqqlwq 发表于 2019-11-4 14:33
谢谢卢老师!
我之前问商家他说8136也是正式版,请问下您说的不兼容的情况是指什么样的情况呢?没有经验 ...

有些不在Intel ARK里能查到的CPU挑主板

由于之前有些用户滥发垃圾广告,被封了IP。但你的情况未必是这个原因,封IP的话是连访问首页都没法访问。换个浏览器试试

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-4 14:33:55 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 mgqqlwq 于 2019-11-4 14:36 编辑
sobereva 发表于 2019-11-2 08:45
8136即便现在在淘宝上也很少见,价格也没比8173M便宜。
如果你问的那家8136确实便宜三千,可以考虑,但 ...

谢谢卢老师!
我之前问商家他说8136也是正式版,请问下您说的不兼容的情况是指什么样的情况呢?没有经验,这种U潜在的问题会是什么呢?

另外,卢老师,咱们论坛登陆是限制IP的吗?我遇到的情况是在办公室可以登陆,但是回到家用户名密码登陆不会报错但是点击后并不会登陆,这是为什么呢?

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