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[新手求助] 大家好,用gaussian研究乙醇苯团簇的氢键和弱相互作用选MP2合理吗

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大家好,用gaussian研究乙醇苯团簇的氢键和弱相互作用选MP2/aug-cc-pVDZ或者MP2/6-311G++(d,p)合理吗?

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发表于 Post on 2023-3-17 16:17:56 | 只看该作者 Only view this author
老师您好,我在用MPW1B95-D3/def2QZVP计算氢键体系的分子间相互作用能时会报错“R6DS8: Unable to choose the S8 parameter, IExCor=  911 IXCFnc=  0 ScaHFX=  0.310000 IDFTD=3”,输入文件的控制行是这么写的“#p MPWB95/def2QZVP empiricaldispersion=GD3 IOp(3/76=0690003100)” ,请教下您这是什么问题?但是如果去掉D3校正就可以算了。可是我的D3校正写的方式也没有错误啊~麻烦您了

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发表于 Post on 2016-3-9 22:03:09 | 只看该作者 Only view this author
tjuchan 发表于 2016-3-9 21:36
您好,在计算的过程中又遇到了些迷惑 。请教一下


你这种级别用PWPB95-D3/def2-QZVPP瞬间就算完了,算好几十个原子也就一两个小时的事。高斯里用B2PLYP-D3/jul-cc-pVTZ对这种体系也不会算不动。

M062X本身对于计算pi-pi作用有时不是很准,不能因为恰好-2.70更符合CCSD(T)/CBS就贸然说这个级别最合适,没准换一种构型这个级别又不如其它级别了。不知你考虑BSSE没有,若没考虑应考虑。另外你表格中前两列用的级别一样,数据却不同。
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发表于 Post on 2016-3-9 21:36:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-7 21:03
1 M062X不包含色散校正,但它本身能合理描述色散作用。你用的级别没问题,是well-known能得到理想结果的 ...

您好,在计算的过程中又遇到了些迷惑 。请教一下

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发表于 Post on 2016-3-7 21:52:45 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2016-3-7 21:03
1 M062X不包含色散校正,但它本身能合理描述色散作用。你用的级别没问题,是well-known能得到理想结果的 ...

非常感谢您的解答!知道接下去该怎么做了

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发表于 Post on 2016-3-7 21:03:51 | 只看该作者 Only view this author
tjuchan 发表于 2016-3-7 19:13
您好!我想请教一下您,我研究弱相互作用(两分子作用)的话,希望后续的分析是AIM,RDG,NBO和电荷转移 ...

1 M062X不包含色散校正,但它本身能合理描述色散作用。你用的级别没问题,是well-known能得到理想结果的,同行都懂。
2 应当说几何结构对计算级别远不如能量敏感,所以可以用低级别优化
3 可以
4 显然不同。溶剂下计算相互作用能还得把溶剂化能的变化考虑进去。
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发表于 Post on 2016-3-7 19:13:17 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-28 19:49
一般般,虽然可以,但不是最理想的。
比较推荐M062X/6-311G**优化(如果嫌慢,降到6-31G**也可以),然后 ...

您好!我想请教一下您,我研究弱相互作用(两分子作用)的话,希望后续的分析是AIM,RDG,NBO和电荷转移之类的话;那么优化在B3LYP+D3/6-311+g**下,能量在PWPB95-D3/def2-QZVPP下算的,但是老师(我们课题组之前没有人搞过这样的计算)问起,
1、你们搞这些计算所采用的什么方法基组的选取有什么依据么?
2、为什么能量用的方法比优化用的方法高那么多呢,意思是你的优化采用的方法和基组是不是特别低呢?
3、优化加了D3之后,后续分析还能采用优化方法基组下计算频率的chk文件吗?
4、高斯算的真空下的作用和实际上有溶剂的下的作用能,是一致的吗?

我准备这样回答不知道行不,但是第4个不知道怎么回答?
1、一般看文献得到适合的方法和基组,描述弱相互作用的需要采用有色散矫正的泛函比如M062X但是速度比B3LYP+D3要慢很多(我没算过,只是看网上)。
2、优化一般采用较低级别的方法和基组是处于速度和精度的考虑,更高的方法和基组下的能量计算是问了更精确的比较;
3、应该是没什么问题的,和没有加D3时候一样分析。
请问下这样行么,不知道能不能说服老师。整个课题组我算是第一个接触这些的,好难啊。

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发表于 Post on 2015-7-29 15:57:42 | 只看该作者 Only view this author
fzmn 发表于 2015-7-29 11:22
请问sob老师频率计算也采用M062X/6-311G**?


频率计算用6-31G*并考虑频率校正因子就足矣了。
不过如果你要在6-311G**下优化,频率计算也得这个基组。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-29 11:22:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-28 19:49
一般般,虽然可以,但不是最理想的。
比较推荐M062X/6-311G**优化(如果嫌慢,降到6-31G**也可以),然后 ...

请问sob老师频率计算也采用M062X/6-311G**?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-29 10:16:18 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-29 10:05
PWPB95-D3/def2-QZVPP不要用counterpoise校正,矫正了可能反倒差
其它的如果计算量有富裕,可以做校正

非常感谢sob老师!

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发表于 Post on 2015-7-29 10:05:06 | 只看该作者 Only view this author
fzmn 发表于 2015-7-29 10:01
sob老师请问能量需要用counterpoise校正吗?

PWPB95-D3/def2-QZVPP不要用counterpoise校正,矫正了可能反倒差
其它的如果计算量有富裕,可以做校正
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-29 10:01:28 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-7-28 19:49
一般般,虽然可以,但不是最理想的。
比较推荐M062X/6-311G**优化(如果嫌慢,降到6-31G**也可以),然后 ...

sob老师请问能量需要用counterpoise校正吗?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-7-29 09:18:34 | 只看该作者 Only view this author
非常感谢sob老师!

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发表于 Post on 2015-7-28 19:50:59 | 只看该作者 Only view this author
liyuanhe211 发表于 2015-7-28 19:46
Truhlar (做M06,M11的那个人) 在一篇文章中写过:

PBE, PBE1PBE, B3P86, MPW1K, B97-1, and BHandHLYP  ...

这个已经是老黄历了,千万别再信这些说法了
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发表于 Post on 2015-7-28 19:49:32 | 只看该作者 Only view this author
一般般,虽然可以,但不是最理想的。
比较推荐M062X/6-311G**优化(如果嫌慢,降到6-31G**也可以),然后在ORCA下用PWPB95-D3/def2-QZVPP下计算相互作用能。如果你偏向于只用高斯,那么相互作用能计算时可以用B2PLYP-D3/jul-cc-pVTZ来做(如果嫌慢,用M062X-D3/6-311+G**也可以)。
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