计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9557|回复 Reply: 5
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Gaussian/gview] 高斯算双杂化的一些奇怪问题

[复制链接 Copy URL]

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

本帖最后由 biogon 于 2019-11-29 09:42 编辑

用高斯跑了个双杂化的单点,今天早上起来发现任务停了,看输出文件末尾有如下的提示You are probably out of disk space.
File extend in NtrEx1 failed; probably out of disk space.
File extend in NtrEx1 failed; probably out of disk space.: Invalid argument

我还以为是硬盘空间满了,但是我一看临时文件也就才2T,我的硬盘有3.4T空间,
我就df -h看了那个硬盘的情况,根本没有使用2T那么多的硬盘
再用ls -lht命令很诡异的显示总共只有46G,
这个问题有人能帮我解决下吗

]GAWH$SC[A3F%%)42WCZYBO.png (5.33 KB, 下载次数 Times of downloads: 29)

]GAWH$SC[A3F%%)42WCZYBO.png

[B@{{C]BIR0X$S_6Y_I1LWQ.png (15.07 KB, 下载次数 Times of downloads: 30)

[B@{{C]BIR0X$S_6Y_I1LWQ.png

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

6#
发表于 Post on 2019-11-30 03:17:22 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2019-11-29 11:55
用高斯在杂化泛函的收敛的波函数作为orca双杂化初猜可以吗,这个在orca里只有纯泛函能收敛,但是作为初猜 ...

可以
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

5#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-29 11:55:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 10:35
用此文的做法
将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法
http://sobereva.com/517(htt ...

用高斯在杂化泛函的收敛的波函数作为orca双杂化初猜可以吗,这个在orca里只有纯泛函能收敛,但是作为初猜还能不能让双杂化收敛

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

4#
发表于 Post on 2019-11-29 10:35:35 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2019-11-29 09:52
我本来也没想用高斯的,但是这个体系用orca双杂化跑scf很难收敛,试了一通方法都不行,我只能试试高斯传 ...

用此文的做法
将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法
http://sobereva.com/517http://bbs.keinsci.com/thread-14905-1-1.html
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

1236

帖子

1

威望

3495

eV
积分
4751

Level 6 (一方通行)

3#
 楼主 Author| 发表于 Post on 2019-11-29 09:52:44 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2019-11-29 09:48
就是硬盘不够。

用ORCA就完事了,又快又不耗那么多硬盘

我本来也没想用高斯的,但是这个体系用orca双杂化跑scf很难收敛,试了一通方法都不行,我只能试试高斯传轨道

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112354

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2019-11-29 09:48:23 | 只看该作者 Only view this author
就是硬盘不够。

用ORCA就完事了,又快又不耗那么多硬盘

只要是scratch目录对应的可用容量满了就会报错,不是看整个硬盘
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 02:50 , Processed in 0.184231 second(s), 25 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list