用QST2方法搜索过渡态出现错误

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-28 11:30:59

丙酮加氢离子变成质子化丙酮

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-30 10:14:57

naonao5205 发表于 2020-1-29 17:31
加一个水或者多个水到底物里面，调整结构，同时关键词scrf=smd，（默认为水）即可

好的，谢谢

naonao5205 · 发表于 Post on 2020-1-29 17:31:24

郭德来发表于 2020-1-28 15:32
那老师怎么即考虑显式溶剂又要考虑隐式溶剂呢，如何用

加一个水或者多个水到底物里面，调整结构，同时关键词scrf=smd，（默认为水）即可

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-28 15:32:50

snljty 发表于 2020-1-28 13:16
不行

那老师怎么即考虑显式溶剂又要考虑隐式溶剂呢，如何用

snljty · 发表于 Post on 2020-1-28 13:16:19

郭德来发表于 2020-1-28 13:06
只考虑隐式溶剂模型可以吗

不行

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-28 13:06:10

snljty 发表于 2020-1-28 13:00
真空下这种反应我感觉8成没有过渡态。
溶剂下质子不会单独存在的，要显式考虑质子从别的分子转移过来，应 ...

只考虑隐式溶剂模型可以吗

snljty · 发表于 Post on 2020-1-28 13:00:28

真空下这种反应我感觉8成没有过渡态。
溶剂下质子不会单独存在的，要显式考虑质子从别的分子转移过来，应该再配合周围的隐式溶剂模型。

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-28 12:00:12

YanLiu 发表于 2020-1-28 11:49
论坛首页搜索。关键字：IRC, 反应物，产物，一样

我看过那个帖子，我把步长调到30了，还是那样

YanLiu · 发表于 Post on 2020-1-28 11:49:20

郭德来发表于 2020-1-28 11:45
用TS法手动调整过了，走IRC只有三帧，反应物和产物一样的

论坛首页搜索。关键字：IRC, 反应物，产物，一样

郭德来 · 发表于 Post on 2020-1-28 11:45:34

YanLiu 发表于 2020-1-28 11:43
建议自己手动调整，不要用QST2方法。

用TS法手动调整过了，走IRC只有三帧，反应物和产物一样的

YanLiu · 发表于 Post on 2020-1-28 11:43:07

建议自己手动调整，不要用QST2方法。

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