计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 5371|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[波函数分析求助] Multiwfn+VMD做静电势穿透图时显示两个分子的极值点求助

[复制链接 Copy URL]

4

帖子

0

威望

63

eV
积分
67

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
Multiwfn+VMD做静电势穿透,我只能显示一个分子的极值点,如何显示第二个分子的极值点,以及两个分子的极值点呢。每次都弄不出第二个分子的极值点。每次点击ESPext.bat都是得到同一个surfanalysis.pdb,改文件名称,里面内容还是一样。 是我自己的问题,应该是哪步没有整明白,谢谢老师。

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

3#
发表于 Post on 2020-6-5 10:41:31 | 只看该作者 Only view this author
.bat里把第一个文件当输入文件,运行后得到surfanalysis.pdb,改名为surfanalysis1.pdb,再把第二个文件当输入文件,运行后又得到surfanalysis.pdb,改名为surfanalysis2.pdb,显然把这俩文件都拖到VMD里显示出来就把两个分子的极值点都显示了

要搞清楚脚本的运行原理,灵活变通,总共就那么几行
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

5万

帖子

99

威望

5万

eV
积分
112356

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2020-6-5 10:00:55 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“Multiwfn+VMD做静电势穿透”改了,以后务必注意
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入“北京科音”微信公众号获取北京科音培训的最新消息、避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气非常高、专业性特别强的综合性理论与计算化学交流QQ群“思想家公社QQ群”:1号:18616395,2号:466017436,3号:764390338,搜索群号能搜到哪个说明目前哪个能加,合计9000人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大的量子化学波函数分析程序)
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu
Money and papers are rubbish, get a real life!

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2024-11-24 07:56 , Processed in 0.341875 second(s), 28 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list