如何理解isostat筛选功能以及使用方法

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-14 09:11:01

各位老师好，关于molclus程序中isostat程序的筛选功能有初步的认识，利用能量和几何结构作为筛选的关键，但是对于一个不是很有经验的我来说，如何对于自己的团簇设定的一个较好的筛选值是困惑的。之前我一直设定能量为0.25kcal/mol，几何结构不做参考（设定99）。下面两个团簇的虽然能量相差小于0.25，但是依旧筛选出来了，仔细比较很小的差别。不知道是什么原因。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-14 13:01:29

isostat得到的结果中，如果一个簇里有多个结构，则其中能量最低的会被作为这个簇的能量。
为了满足这一点，在归簇过程中，当有一个结构被判断应当归入到一个已有的簇的时候，如果这个结构的能量比之前簇的能量更低，此能量会被作为这个簇的新的能量。这个机制导致你看到的那个现象的出现。如果不想让那两个结构被分别输出，加大能量阈值即可。

dongdong · 发表于 Post on 2020-7-14 11:26:52

本帖最后由 dongdong 于 2020-7-14 11:30 编辑

sobereva 发表于 2020-7-14 11:21
把isomers.xyz压缩后上传我看看

isomers(M062X).zip (13.36 KB, 下载次数 Times of downloads: 10)
这是文件，对于isostat在筛选中会剔除重复的结构，不知道0.25的设定的实际意义是不是够准确，或者对于不同的体系如何去选择筛选值更好。对于这个我有些疑问。主要想使得筛选结果让文章更有说服力。

sobereva · 发表于 Post on 2020-7-14 11:21:24

把isomers.xyz压缩后上传我看看

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