CP2k的依赖我都编译完成了，最后编译CP2K出现了问题

美式加糖 · 发表于 Post on 2020-9-12 15:12:47

大家好！最近一直在编译CP2k，遇到了个人无法解决的问题想求助大家。我按照刘博的教程进行编译的，集群是Centos 7.4，装的是GCC-4.8.5。由于没有管理员权限我在自己账号下安装了GCC-9.3.0，然后也顺利完成了CP2k所有依赖的安装（没有报错）。
使用的toolchain命令为
./install_cp2k_toolchain.sh --math-mode=mkl --mpi-mode=openmpi --with-openmpi=install --with-scalapack=no --with-ptscotch=install --with-parmetis=install --with-metis=install --with-superlu=install --with-pexsi=install --with-quip=install --with-plumed=install --with-cmake=system --with-sirius=no

但是在最后编译CP2k的时候提示如下的报错

我查了一下atlas好像是atlas-math数学库，但我选择的是intel-mkl。
目前不知道如何解决了。

本人刚入论坛不久，如果有需要提供的资料，请大家告知一下。如果有不合规的地方，立即修改。

美式加糖 · 发表于 Post on 2020-9-14 09:37:01

wangtaochem 发表于 2020-9-13 21:11
运行这一条试试LD_LIBRARY_PATH=XXXX:$LD_LIBRARY_PATH
XXXX是你自己安装的GCC的lib64路径。

你好，这项我已经加进去了，但问题好像并不是找不到libgfortran.o.5,而是不知什么原因去调用了atlas-math,它使用的libgfortran.o.3，GCC-9.3已经不支持了

wangtaochem · 发表于 Post on 2020-9-13 21:11:55

运行这一条试试LD_LIBRARY_PATH=XXXX:$LD_LIBRARY_PATH
XXXX是你自己安装的GCC的lib64路径。

美式加糖 · 发表于 Post on 2020-9-13 11:30:57

sobereva 发表于 2020-9-13 03:52
你如果着急用就直接下载官网上预编译好的OpenMP并行版就完了，什么乱七八糟的都不需要装，直接运行，非常容 ...

好的，谢谢提醒

sobereva · 发表于 Post on 2020-9-13 03:52:22

你如果着急用就直接下载官网上预编译好的OpenMP并行版就完了，什么乱七八糟的都不需要装，直接运行，非常容易

美式加糖 · 发表于 Post on 2020-9-12 18:47:28

chenjaekr 发表于 2020-9-12 16:53
source下tool/toolchain/install/setup

你好，在编译前source 过了，但还是有这个问题

chenjaekr · 发表于 Post on 2020-9-12 16:53:31

source下tool/toolchain/install/setup

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