求助g_mmpbsa算PB部分的时候报错：Segmentation fault (core dumped)

eagletyr · 发表于 Post on 2020-9-17 14:14:16

求助：用g_mmpbsa计算第二步的PB部分时，报错：Parsing input file pqbyBxqA.in... Segmentation fault (core dumped)。
运行官方的体系http://rashmikumari.github.io/g_ ... binding_energy.html，以及自己的体系时均报此错。
gromacs版本为：2019.5. 系统为centos 7.6。 g_mmpbsa版本为官方已编译好的（已内置APBS）。已知同样的软件版本在另一台电脑上可正常运行。多谢。

Zhaoyang · 发表于 Post on 2021-6-27 03:57:30

sobereva 发表于 2021-6-26 03:43
索性换个工具
http://bbs.keinsci.com/thread-23634-1-1.html

感谢，我学习一下

sobereva · 发表于 Post on 2021-6-26 03:43:12

Zhaoyang 发表于 2021-6-26 02:31
我也遇到了这样的错误，gromacs用的是最新版的，g_mmpbsa用的是预编译5.1.x的，系统是centos8，请问有解决 ...

索性换个工具
http://bbs.keinsci.com/thread-23634-1-1.html

Zhaoyang · 发表于 Post on 2021-6-26 02:31:36

我也遇到了这样的错误，gromacs用的是最新版的，g_mmpbsa用的是预编译5.1.x的，系统是centos8，请问有解决这个问题的了吗

monte · 发表于 Post on 2021-4-22 14:11:42

我也是这个问题，gromacs2018.8也是这样
Parsing input file pTZdmjsA.in...
Segmentation fault (core dumped)
系统是centos7.8的

eagletyr · 发表于 Post on 2021-4-1 10:40:06

caoyangang 发表于 2021-2-4 10:42
请问楼主，你的问题解决了吗，我遇见同样的问题，可否指教一二

没解决，还是同样的问题

caoyangang · 发表于 Post on 2021-2-4 10:42:40

请问楼主，你的问题解决了吗，我遇见同样的问题，可否指教一二

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[GROMACS] 求助g_mmpbsa算PB部分的时候报错：Segmentation fault (core dumped)

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