Gview看HOMO和LUMO不全的问题

sunnyyg · 发表于 Post on 2015-10-24 13:21:20

本帖最后由 sunnyyg 于 2015-10-24 13:23 编辑

大家好，我将卟啉衍生物分子基态优化后，关键词：#p opt freq cam-b3lyp/genecp scrf=(iefpcm,solvent=thf) pop=(nbo,savenbo) geom=connectivity
得到chk文件，转换成fchk后，用gview查看HOMO。右键-results-surfaces and contours-new cube-new surface
结构只看到了一部分

HOMO应该分布在整体卟啉环上，可是怎么只有一部分呢？

anmin0127 · 发表于 Post on 2015-10-26 09:22:52

sunnyyg 发表于 2015-10-26 09:09
log文件结尾是这样的：
IT MATTERS NOT HOW DEEP YOU PLOW,
BUT HOW LONG YOU STAY IN THE FURROW.

20多天？这几句话看的话是没有错误啊

sunnyyg · 发表于 Post on 2015-10-26 09:09:56

anmin0127 发表于 2015-10-26 08:59
计算是正常完成的吗？

log文件结尾是这样的：
IT MATTERS NOT HOW DEEP YOU PLOW,
BUT HOW LONG YOU STAY IN THE FURROW.
Job cpu time: 20 days 17 hours 43 minutes 21.3 seconds.
File lengths (MBytes): RWF= 14575 Int= 0 D2E= 0 Chk= 114 Scr= 1
Normal termination of Gaussian 09 at Sat Oct 24 05:19:31 2015.

anmin0127 · 发表于 Post on 2015-10-26 08:59:08

计算是正常完成的吗？

sobereva · 发表于 Post on 2015-10-25 02:17:18

去掉saveNBO

NBO和MO完全是两码事。默认将MO保存到chk里，你写这个说明将NBO代替MO保存到chk里。NBO是高度定域的轨道，你看到的自然只是定域在局部的轨道了，这根本不是HOMO。

附：
看NBO轨道的方法：
使用Multiwfn绘制NBO及相关轨道
http://sobereva.com/134

看分子轨道的方法：
使用Multiwfn观看分子轨道
http://sobereva.com/269

diaolanxinyu · 发表于 Post on 2015-10-24 22:13:13

或者尝试调节isovalue的值来显示MO,
或者把fchk文件上传，
或者只算加pop=nbo的单点能再画MO试试

diaolanxinyu · 发表于 Post on 2015-10-24 22:04:59

直接点Edit-MOs试试

sunnyyg · 发表于 Post on 2015-10-24 14:59:21

用了multiwfn也不行

卒之爱 · 发表于 Post on 2015-10-24 14:26:53

用别的软件试试，比如Camcraft

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