多元环的gjf怎么转化成普通的键线式

zjutwbai

lz 用gussian算了几个多元环的构象，需要把构象重新用键线式画出来……不然很难看清楚区别……

难道用三视图？——觉得似乎不太像是化学的东西

还有就是用chemdraw自己调……觉得也不是很靠谱？

求教各位是否知悉某些软件或者程序能解决这个问题……或者各位碰到这个问题的时候是怎么解决的？

请以己内酯的构象为例……

liyuanhe211

GaussView里在原子列表中删掉所有的氢原子（此处未截图这一步）

存成.sdf文件

ChemDraw打开（需要某个版本以上）

打开后你会发现你得到了一个立体的ChemDraw图，选中打开的结构，用圈出的工具可以像GaussView里旋转得到的构象至你想要的形态。

由于GaussView里面键级是假的，只是用键长猜的。所以部分键级需要自己调整一下（如本例中的C=O）。

最后，你就想要这个级别的构象精度的话，还是去Chem3D里MM2 minimize一下用ChemDraw打开就完了。