计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 9574|回复 Reply: 2
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 求助:reaxff力场文件中的X原子指的是什么原子,lammps中电场和reaxff兼容吗?

[复制链接 Copy URL]

30

帖子

0

威望

1520

eV
积分
1550

Level 5 (御坂)

本帖最后由 ggshining 于 2020-10-14 16:38 编辑

本人想做质子传递相关的分子动力学模拟,质子传递时涉及成键和断键过程,故想用reaxff力场做(用lammps)。刚开始接触reaxff反应力场,看到van Duin的几篇文章中用了reaxff模拟水中质子的性质:J. Phys. Chem. B 2017, 121, 24, 6021–6032;J. Phys. Chem. Lett. 2018, 9, 18, 5445–5452;J. Phys. Chem. B 2018, 122, 14, 4083–4092,查看力场文件时发现原子种类中有X原子,如图

我想知道X原子代表的是什么?请各位大佬赐教! 此外,我看到费米科技网站中说ADF中的reaxff不能加电场,因为加电场后原子跨越Cell边界的时候,会出现EEM电荷计算得到非物理的大值而报错停止,那lammps是否也有这个问题呢,或者说reaxff和电场是否兼容,会不会导致不正确的结果?

82

帖子

0

威望

489

eV
积分
571

Level 4 (黑子)

3#
发表于 Post on 2022-6-11 22:18:28 | 只看该作者 Only view this author
可以用电场命令的,我见过开发reaxff力场的用电场,更有一区二区在用电场命令结合reaxff

442

帖子

0

威望

1500

eV
积分
1942

Level 5 (御坂)

2#
发表于 Post on 2020-10-14 19:25:18 | 只看该作者 Only view this author
X原子就是non-sense的原子,不用管。

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-24 13:14 , Processed in 0.170620 second(s), 24 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list