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[综合交流] 求助外重组能计算公式中的R

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请问:外重组能计算公式中的R,是分子几何中心?还是质心?

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发表于 Post on 2020-10-21 03:47:19 | 只看该作者 Only view this author
相关信息看
谈谈分子半径的计算和分子形状的描述
http://sobereva.com/190
乱谈外重组能的计算
http://sobereva.com/333

学术讨论贴别发到大杂烩板块。给你移动了
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,并反映出帖子具体内容,避免有任何歧义,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“外重组能计算”改了,以后务必注意,下次将扣分处理。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-19 10:39:21 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-18 20:24
如果按我说的方法计算donor和acceptor半径,就不需要纠结算R是以什么点为基准了,因为这个公式是把两个分 ...

好的,已经计算了,谢谢您

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发表于 Post on 2020-10-18 20:24:13 | 只看该作者 Only view this author
哎呀妈呀 发表于 2020-10-18 18:42
我也是利用刚刚您提到的方法计算donor和acceptor半径,我看了两篇文章(附件):对于R,只说了给受体的中 ...

如果按我说的方法计算donor和acceptor半径,就不需要纠结算R是以什么点为基准了,因为这个公式是把两个分子近似为球,而且认为两个球刚好接触的时候发生电子转移,所以R总是等于两个半径之和。这样最大的好处是你不需要优化donor-acceptor复合物,只需要分别计算两者的volume就行了
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-18 18:42:14 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-18 18:19
我看到一篇文章用的是donor和acceptor半径之和,而donor和acceptor半径是用高斯的volume关键字算donor和acc ...

我也是利用刚刚您提到的方法计算donor和acceptor半径,我看了两篇文章(附件):对于R,只说了给受体的中心间距,并没有说清楚是质心还是几何中心。
我先看一下您发的文章,谢谢

Absolute Rate of Charge Separation and Recombination.pdf

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Electron Transfer Reactions in Chemistry _ Theory and Experiment (Nobel Lecture)__.pdf

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发表于 Post on 2020-10-18 18:19:00 | 只看该作者 Only view this author
我看到一篇文章用的是donor和acceptor半径之和,而donor和acceptor半径是用高斯的volume关键字算donor和acceptor的体积,再按球体积公式换算成有效球半径。
DOI: 10.1021/jacs.7b08902
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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