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[ORCA] 求教用ORCA计算吸附体系,总是优化不成功

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大家好,我是刚入门量化计算的。近期碰到一些问题如下:
1.目前研究一个吸附体系:季铵盐化合物与铬酸根的相互作用。输入文件是画好季铵盐化合物与铬酸根的.xyz文件,然后用multiwfn生成orca的输入文件;
季铵盐化合物与铬酸根能分别完成结构优化,但是把它们摆到一起,怎么都优化不出来。要么SCF不收敛,要么跑了100圈优化还不能成功。inp文件与报错信息附在下方。

2.关于自旋多重度设定。我这个体系,季铵盐化合物+1价,自旋多重度为1,铬酸根CrO4是-2价,自旋多重度应该也为1??? 那我把两个放一块,电荷为-1,自旋多重度设为1正确么???


3. 自旋多重度应该是计算之前的还是计算之后的?比如反应前,A,B化合物各有一个未成对电子,那自旋多重度应该是3,反应后成对了,那自旋多重度应该是1,那输入文件应该填1还是3?


! B3LYP D3 def2-SVP def2/J RIJCOSX opt noautostart miniprint nopop
%maxcore  1000
%pal nprocs   24 end
* xyz -1 1
   N       -0.49790       -0.76880       -2.09630
   C       -1.53770       -0.19090       -1.04880
   C       -0.95040       -0.04060       -3.36950
   C       -0.66860       -2.27080       -2.54230
   C        0.99090       -0.26800       -1.97880
   C       -1.27540       -0.77350        0.32800
   C       -0.44660       -0.16650        1.19320
   C       -1.86520       -1.91340        0.72330
   C       -0.21140       -0.68270        2.41010
   C       -1.62860       -2.42750        1.94020
   C       -0.79630       -1.82680        2.81440
   C       -0.59590       -2.39100        4.02360
   C        0.19000       -1.94320        5.01590
   H       -2.57950       -0.43750       -1.36150
   H       -1.46020        0.92070       -0.99880
   H       -2.00660       -0.27810       -3.63190
   H       -0.33060       -0.32080       -4.25120
   H       -0.88050        1.06600       -3.26230
   H       -1.73290       -2.49360       -2.78520
   H       -0.35950       -2.96370       -1.72370
   H       -0.03090       -2.50180       -3.42610
   H        1.02750        0.83700       -1.84310
   H        1.58200       -0.55180       -2.87910
   H        1.49510       -0.72950       -1.09660
   H        0.05500        0.77070        0.89870
   H       -2.55080       -2.43950        0.03820
   H        0.48340       -0.12390        3.05630
   H       -2.14290       -3.36900        2.20170
   H       -1.12770       -3.33360        4.25290
   H        0.79060       -1.02570        4.96350
   H        0.26390       -2.50540        5.96090
   O        2.57950        3.36900       -4.65530
   O        0.14740        2.27840       -5.87290
  Cr        1.96200        2.23810       -5.96090
   O        2.31130        0.54670       -5.39620
   O        1.64890        2.35100       -4.13900
*





   ERROR                        *
               *        SCF NOT CONVERGED AFTER 125 CYCLES         *
               *****************************************************

ORCA finished by error termination in SCF
Calling Command: mpirun -np 24  /data/ssoft/orca421/orca_scf_mpi 1.gbw b 1
[file orca_tools/qcmsg.cpp, line 458]:
  .... aborting the run

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-27 07:22:31 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-26 20:29
嗯,wB97M-V慢一些,但是更准确。
PBE0是一个杂化泛函,在高斯里叫PBE1PBE,可以认为和B3LYP同级别,但 ...

原来如此,以后着这种体系优化就用PBE0了。谢谢

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发表于 Post on 2020-10-26 20:29:21 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 wzkchem5 于 2020-10-26 21:04 编辑
renzhogn424 发表于 2020-10-25 21:40
谢谢,为了提高精度,我用了wB97M-V /def2-TZVP,PBE0我还不大了解是个什么级别的泛函

嗯,wB97M-V慢一些,但是更准确。
PBE0是一个杂化泛函,在高斯里叫PBE1PBE,可以认为和B3LYP同级别,但比B3LYP更适合金属配合物
另:我之前没注意你问的是单点能的级别,不是几何优化的级别。那确实必须所有原子都triple zeta。

Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
GitHub:https://github.com/wzkchem5
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-25 21:40:34 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-25 19:57
我觉得可以考虑PBE0-D3,基组的话如果你的Cr不涉及变价可以用你现在的基组,如果之后Cr要变价,建议对Cr ...

谢谢,为了提高精度,我用了wB97M-V /def2-TZVP,PBE0我还不大了解是个什么级别的泛函

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发表于 Post on 2020-10-25 19:57:43 | 只看该作者 Only view this author
renzhogn424 发表于 2020-10-24 17:07
谢谢,我用xTB软件verytight优化了,放orca里终于收敛。。。话说,这个体系算单点能用什么泛函和基组好呀 ...

我觉得可以考虑PBE0-D3,基组的话如果你的Cr不涉及变价可以用你现在的基组,如果之后Cr要变价,建议对Cr改用def2-TZVP,改善对Cr的描述
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-24 17:07:17 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-23 19:08
chem3d里可能只有八面体六配位的Cr(III)的力场参数,所以把[CrO4]2-看成是缺了两个配体的八面体配合物来 ...

谢谢,我用xTB软件verytight优化了,放orca里终于收敛。。。话说,这个体系算单点能用什么泛函和基组好呀?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-24 08:19:55 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-10-23 22:24
QE好像没有conda库。QE主要功能不难装,可以参考卢老师博文http://bbs.keinsci.com/thread-18600-1-1.htm ...

非常感谢。

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发表于 Post on 2020-10-23 22:24:48 | 只看该作者 Only view this author
renzhogn424 发表于 2020-10-23 22:16
谢谢啦,我只好用现成的了。  conda我还没用过呢,能装quantum espresso啥的不

QE好像没有conda库。QE主要功能不难装,可以参考卢老师博文http://bbs.keinsci.com/thread-18600-1-1.html。新手上路为了熟悉软件,不太介意效率损失的话,直接yum也行。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 22:16:25 | 只看该作者 Only view this author
snljty 发表于 2020-10-23 21:46
不需要自己编译,有release版本,用conda也能装。

谢谢啦,我只好用现成的了。  conda我还没用过呢,能装quantum espresso啥的不

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发表于 Post on 2020-10-23 21:46:19 | 只看该作者 Only view this author
renzhogn424 发表于 2020-10-23 21:41
感谢解答,没想到这个大牌软件有如此不足。。。。

GFN2-xTB不是https://github.com/grimme-lab/xtb这 ...

不需要自己编译,有release版本,用conda也能装。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 21:42:17 | 只看该作者 Only view this author
喵星大佬 发表于 2020-10-23 21:12
力场稍微优化一下的话免费的IQmol不香嘛

看了一下,我还是准备半经验吧

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 21:41:20 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-23 19:08
chem3d里可能只有八面体六配位的Cr(III)的力场参数,所以把[CrO4]2-看成是缺了两个配体的八面体配合物来 ...

感谢解答,没想到这个大牌软件有如此不足。。。。

GFN2-xTB不是https://github.com/grimme-lab/xtb这里的???最新版本6.3.3?我一直编译不成功。。。唉。。
ORCA里面也有这个么?

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发表于 Post on 2020-10-23 21:12:45 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2020-10-23 19:08
chem3d里可能只有八面体六配位的Cr(III)的力场参数,所以把[CrO4]2-看成是缺了两个配体的八面体配合物来 ...

力场稍微优化一下的话免费的IQmol不香嘛

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发表于 Post on 2020-10-23 19:08:31 | 只看该作者 Only view this author
renzhogn424 发表于 2020-10-23 10:15
谢谢社长! 因为这里是计算过渡金属配合物的弱相互作用,之前看了您的博文(http://sobereva.com/272), ...

chem3d里可能只有八面体六配位的Cr(III)的力场参数,所以把[CrO4]2-看成是缺了两个配体的八面体配合物来优化。因为chem3d是面向生物分子开发的(这也是为什么它的比较新一些的版本叫做chembio3d),所以不会考虑那些生物体系里不存在的配位模式或成键模式,包括你要画个自由基,它都有强烈的补氢欲望,存成某些格式以后再打开就发现多了氢。
其实用ORCA的GFN2-xTB就可以优化,相比chem3d的唯一缺点就是没有图形界面,除此之外很好用,对过渡金属一般定性正确。
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?user=XW6C6eQAAAAJ
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1133/1776.htm
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2020-10-23 10:26:46 | 只看该作者 Only view this author
biogon 发表于 2020-10-23 08:39
力场哪能行,还是要用半经验

好的,我试试去

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