研究温度对蛋白（溶于水）的影响，如何设置不同温度

karme · 发表于 Post on 2020-11-9 12:51:42

我想要研究温度对蛋白（蛋白溶于水）的影响，分别是25，40，80，120度
我想知道如何设定温度，是调整nvt文件中的参数吗，如何调整呢

karme · 发表于 Post on 2020-11-10 09:10:33

谢谢老师

sobereva · 发表于 Post on 2020-11-10 02:08:16

有别人回复之前若需要对帖子进行修改、补充，应直接编辑原帖，不要通过回帖进行补充

1 修改ref_t

2 先说清楚里体系都有什么物质。通常蛋白质一个控温组，抗衡离子和溶剂一个组

一般情况下，模拟一开始从0 K线性升温到实际模拟用的温度

karme · 发表于 Post on 2020-11-9 14:56:20

还有就是，我设定温度方法为v-rescale，对于同一个蛋白，tc-group怎么分。温度改变速率又应该怎么设定呢

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