求助：gromacs生成tpr报错

不明嚼栗子

老师们好，我在生成tpr文件时遇到报错：Removing all charge groups because cutoff-scheme=Verlet
Analysing residue names:
There are:    12        Ion residues
There are:   156      Other residues
Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups...
Analysing residues not classified as Protein/DNA/RNA/Water and splitting into groups...
Segmentation fault

想知道该如何解决这个问题？谢谢老师！

sobereva

光从这上说不清楚，mdp不合理、拓扑文件有bug都有可能。一般碰见这种问题的思路是先尽量简化体系，反复对比，弄清楚什么因素导致的。但也有可能是当前gmx程序问题，如果输入文件检查不出毛病就换版本再试。