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[Gaussian/gview] 分子优化时,存在虚频

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请问大家:我最近做了一些有机分子的高斯计算,气相计算时opt+freq,反应物和产物,没有虚频,但是,加上溶剂化(CPCM, DMSO)和弱作用DFT-D3(BJ)时,一直有一个小虚频(-8.3),换方法,多次优化,仍然存在虚频。想问的是这个虚频不消掉的情况下,这个能量值能用吗?

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发表于 Post on 2019-11-29 09:55:22 | 只看该作者 Only view this author

哈,太好了,谢谢!

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发表于 Post on 2019-11-29 09:52:39 | 只看该作者 Only view this author
lanthanum 发表于 2019-11-29 00:00
请问,现在的G16 A03的GD3BJ有没有解析Hessian?
如果还没有,课题从开始全部的opt freq就都用零阻尼,是 ...

北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2019-11-29 00:00:59 | 只看该作者 Only view this author
本帖最后由 lanthanum 于 2019-11-29 00:25 编辑

请问,现在的G16 A03的GD3BJ有没有解析Hessian?
如果还没有,课题从开始全部的opt freq就都用零阻尼,是否比较稳妥?

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发表于 Post on 2016-9-3 22:03:45 | 只看该作者 Only view this author
您好,请问您的问题解决了么?我最近也遇到了这个问题,也是一直有一个-8.3左右的虚频。我看有回复说有这个虚频能量差别不大?那我可以用这个结构继续后边的计算么?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-18 17:08:58 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-18 09:13
可以一试,但我估计还是会有虚频,主要是GD3BJ由于没有解析Hessian,算解析频率的时候实际上和几何优化 ...

您好,正如您所说,优化的结果是有虚频的,但结构基本不变。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-18 09:24:50 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-18 09:13
可以一试,但我估计还是会有虚频,主要是GD3BJ由于没有解析Hessian,算解析频率的时候实际上和几何优化 ...

好的,我提交了几个作业,先看看结果如何。谢谢您的帮助

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发表于 Post on 2015-11-18 09:13:28 | 只看该作者 Only view this author
icc-jly 发表于 2015-11-18 09:00
您好,我根据您的建议:用GD3的方法优化,加上opt=tight int=ultrafine,结果:虚频消失。能否在这个结构 ...


可以一试,但我估计还是会有虚频,主要是GD3BJ由于没有解析Hessian,算解析频率的时候实际上和几何优化不严格对应。如果你用GD3BJ继续优化发现结构也没什么改变,而且你的目的只是计算相互作用能,那么虚频就不管它就完了。
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-18 09:00:15 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-17 09:27
BJ比零阻尼在能量计算上强一点,不代表几何优化它就有什么可察觉得到的优势,更何况能量对几何结构根本就 ...

您好,我根据您的建议:用GD3的方法优化,加上opt=tight int=ultrafine,结果:虚频消失。能否在这个结构的基础上,继续用GD3BJ优化试试?

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发表于 Post on 2015-11-17 09:27:36 | 只看该作者 Only view this author
icc-jly 发表于 2015-11-17 08:47
您好,我是看了您的帖子,知道DFT-D3BJ的方法比DFT-D3的方法好,所以整体采用的D3BJ的方法。已经完成了大 ...

BJ比零阻尼在能量计算上强一点,不代表几何优化它就有什么可察觉得到的优势,更何况能量对几何结构根本就不敏感。
先用零阻尼试试就看是否是这个原因造成的
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-17 08:47:34 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2015-11-17 00:26
把GD3BJ改成GD3,用opt=tight int=ultrafine再试。GD3BJ优化导致最后频率计算出现虚频是正常的,因为BJ阻尼 ...

您好,我是看了您的帖子,知道DFT-D3BJ的方法比DFT-D3的方法好,所以整体采用的D3BJ的方法。已经完成了大部分的优化计算,只有3个分子在能量优化时,有虚频(-8.3),并且opt=tight, calcall等都计算过,还是有这个小虚频。既然,虚频小,对能量影响比较小,消除后的能量与现在的能量应该相差不大,我能直接用这个值吗?因为重新更改方法计算量太大了,并且对于弱作用的计算也不好。

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发表于 Post on 2015-11-17 00:26:23 | 只看该作者 Only view this author
把GD3BJ改成GD3,用opt=tight int=ultrafine再试。GD3BJ优化导致最后频率计算出现虚频是正常的,因为BJ阻尼在高斯里还没有准确的Hessian。

还不行的话,再把calcall加上。

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发表于 Post on 2015-11-16 21:13:21 | 只看该作者 Only view this author
icc-jly 发表于 2015-11-16 15:46
您好,opt里面写上tight,gdiis等我都做过了,有的出现反复震荡,有的正常走完,都是虚频消不掉。
你说 ...

震荡了就去解决震荡的问题。不是震荡了就不用了。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2015-11-16 20:51:13 | 只看该作者 Only view this author
有的老师说:小虚频(-8.3),对能量影响比较小,消除后的能量与现在的能量应该相差不大,所以,我能直接用这个能量值吗?我不确定

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发表于 Post on 2015-11-16 17:40:38 | 只看该作者 Only view this author
有时候这种小虚频是软件自已的问题, 称之为计算人工假像,特别是对这类分子又大又不好收敛的. Gaussain可能在小虚频方面比turbomole这些更严格.

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