请问如何构建非标准氨基酸残基的charmm力场文件

AKB2005 · 发表于 Post on 2021-1-30 22:43:40

大家好，我看了一些文献，想使用charmm36m力场来模拟多肽的折叠情况，但是我的多肽中有一些自己构建的残基，请问要如何构建其charmm力场的文件？
我学习了amber和gromos的非标准残基的构建方法，但是发现没有类似charmm力场的构建，大家是有什么简单的方法？

大漠孤烟 · 发表于 Post on 2021-2-9 16:17:58

你好，请问您非标准残基的力场是怎么构建的啊，能加您一个联系方式

tjuptz · 发表于 Post on 2021-1-31 23:02:05

转成gromacs格式再做，应该和amber gromos 力场的一样吧

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[GROMACS] 请问如何构建非标准氨基酸残基的charmm力场文件