计算化学公社

 找回密码 Forget password
 注册 Register
Views: 10944|回复 Reply: 1
打印 Print 上一主题 Last thread 下一主题 Next thread

[Lammps] 分子力场参数的意思求助

[复制链接 Copy URL]

2

帖子

0

威望

43

eV
积分
45

Level 2 能力者

跳转到指定楼层 Go to specific reply
楼主
DATE: 2010-02-19 CONTRIBUTOR: Aidan Thompson, athomps@sandia.gov CITATION: Strachan et al, Phys Rev Lett, 91, 098301 (2003) COMMENT: Reactive MD-force field nitramines (RDX/HMX/TATB/PETN): Strachan, A.; et al. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 098301
39       ! Number of general parameters                                       
   50.0000 !Overcoordination parameter                                          
    9.4514 !Overcoordination parameter                                          
   30.0000 !Valency angle conjugation parameter                                 
  216.4305 !Triple bond stabilisation parameter                                 
   12.4838 !Triple bond stabilisation parameter                                 
    0.0000 !C2-correction                                                      
    1.0701 !Undercoordination parameter                                         
    7.5000 !Triple bond stabilisation parameter                                 
   11.9083 !Undercoordination parameter                                         
   13.3822 !Undercoordination parameter                                         
  -10.4637 !Triple bond stabilization energy                                    
    0.0000 !Lower Taper-radius                                                  
   10.0000 !Upper Taper-radius                                                  
    2.8793 !Not used                                                            
   33.8667 !Valency undercoordination                                          
    3.5895 !Valency angle/lone pair parameter                                   
    1.0563 !Valency angle                                                      
    2.0384 !Valency angle parameter                                             
    6.1431 !Not used                                                            
    6.9290 !Double bond/angle parameter                                         
    0.0283 !Double bond/angle parameter: overcoord                              
    0.0570 !Double bond/angle parameter: overcoord                              
   -2.4837 !Not used                                                            
    5.8374 !Torsion/BO parameter                                                
   10.0000 !Torsion overcoordination                                            
    1.8820 !Torsion overcoordination                                            
   -1.2327 !Conjugation 0 (not used)                                            
    2.1861 !Conjugation                                                         
    1.5591 !vdWaals shielding                                                   
    0.0100 !Cutoff for bond order (*100)                                       
    5.2216 !Valency angle conjugation parameter                                 
    3.4021 !Overcoordination parameter                                          
   38.5241 !Overcoordination parameter                                          
    2.1533 !Valency/lone pair parameter                                         
    0.5000 !Not used                                                            
   20.0000 !Not used                                                            
    5.0000 !Molecular energy (not used)                                         
    2.0000 !Version number
    6.5560 !Valency angle conjugation parameter                                 
  4    ! Nr of atoms; cov.r; valency;a.m;Rvdw;Evdw;gammaEEM;cov.r2;#            
            alfa;gammavdW;valency;Eunder;Eover;chiEEM;etaEEM;n.u.               
            cov r3;Elp;Heat inc.;n.u.;n.u.;n.u.;n.u.                           
            ov/un;val1;n.u.;val3,vval4                                          
C    1.3742   4.0000  12.0000   1.9684   0.1723   0.8712   1.2385   4.0000     
      9.4606   2.1346   4.0000  31.0823  79.5548   5.7254   6.9235   0.0000     
      1.2104   0.0000 183.7012   5.7419  33.3951  11.9957   0.8563   0.0000     
     -2.8983   2.5000   1.0564   4.0000   2.9663   0.0000   0.0000   0.0000     
H    0.6867   1.0000   1.0080   1.3525   0.0616   0.8910  -0.1000   1.0000     
      9.3858   5.0013   1.0000   0.0000 121.1250   3.8446  10.0839   1.0000     
     -0.1000   0.0000  58.4228   3.8461   3.2540   1.0000   1.0698   0.0000     
    -15.7683   2.1504   1.0338   1.0000   2.8793   0.0000   0.0000   0.0000     
O    1.3142   2.0000  15.9990   1.9741   0.0880   0.8712   1.1139   6.0000     
     10.2186   7.7719   4.0000  29.5271 116.0768   8.5000   7.1412   2.0000     
      0.9909  14.9473  69.2812   9.1371   1.6258   0.1863   0.9745   0.0000     
     -3.5965   2.5000   1.0493   4.0000   2.9225   0.0000   0.0000   0.0000     
N    1.2450   3.0000  14.0000   1.9951   0.1088   1.0512   1.1911   5.0000     
      9.9303   7.8431   4.0000  32.4758 100.0000   6.7768   6.8035   2.0000     
      1.0636   0.1045 128.0119   2.1604   2.9464   2.5181   0.9745   0.0000     
     -4.0959   2.0047   1.0183   4.0000   2.8793   0.0000   0.0000   0.0000     
10      ! Nr of bonds; Edis1;LPpen;n.u.;pbe1;pbo5;13corr;pbo6                  
                         pbe2;pbo3;pbo4;Etrip;pbo1;pbo2;ovcorr                  
  1  1 141.9346 113.4487  67.6027   0.1554  -0.3045   1.0000  30.4515   0.4283  
         0.0801  -0.2113   8.5395   1.0000  -0.0933   6.6967   1.0000   0.0000  
  1  2 163.6889   0.0000   0.0000  -0.4525   0.0000   1.0000   6.0000   0.5921  
        12.1053   1.0000   0.0000   1.0000  -0.0097   8.6351   0.0000   0.0000  
  2  2 169.8421   0.0000   0.0000  -0.3591   0.0000   1.0000   6.0000   0.7503  
         9.3119   1.0000   0.0000   1.0000  -0.0169   5.9406   0.0000   0.0000  
  1  3 164.0476 117.4881  72.1261  -0.6031  -0.1795   1.0000  14.9755   0.5413  
         1.2626  -0.3063   7.0000   1.0000  -0.1588   4.5000   0.0000   0.0000  
  3  3 110.4748 155.6441  40.0000   0.1150  -0.1054   1.0000  28.5221   0.2000  
         0.9590  -0.2635   8.5715   1.0000  -0.1007   6.8548   1.0000   0.0000  
  1  4 130.7147 175.2276  97.2523  -0.0368  -0.4942   1.0000  26.7545   0.5133  
         0.3296  -0.3653   7.0000   1.0000  -0.1171   5.1025   1.0000   0.0000  
  3  4  85.4950 114.0081  70.1453   0.5778  -0.1070   1.0000  16.6611   0.2339  
         0.3474  -0.1948   8.3762   1.0000  -0.1089   5.8148   1.0000   0.0000  
  4  4 157.7518  67.1322 160.9732  -0.5869  -0.1824   1.0000  12.0000   0.7136  
         0.8204  -0.1657  10.6490   1.0000  -0.0967   4.5976   1.0000   0.0000  
  2  3 224.3076   0.0000   0.0000  -0.6280   0.0000   1.0000   6.0000   1.0000  
         5.0050   1.0000   0.0000   1.0000  -0.0512   5.1982   0.0000   0.0000  
  2  4 212.1772   0.0000   0.0000  -0.3585   0.0000   1.0000   6.0000   0.3316  
        10.4316   1.0000   0.0000   1.0000  -0.0658   6.4545   0.0000   0.0000  
  6    ! Nr of off-diagonal terms; Ediss;Ro;gamma;rsigma;rpi;rpi2               
  1  2   0.0464   1.8296  10.1311   1.0029  -1.0000  -1.0000                    
  2  3   0.0375   1.7275  10.8037   0.8813  -1.0000  -1.0000                    
  2  4   0.0509   1.7672  10.4261   0.9990  -1.0000  -1.0000                    
  1  3   0.1036   1.8869   9.5668   1.3590   1.1099   1.1534                    
  1  4   0.1971   1.7356  10.0734   1.2754   1.2113   1.1172                    
  3  4   0.0535   1.6709  10.8180   1.2968   1.1416   1.0167                    
42    ! Nr of angles;at1;at2;at3;Thetao,o;ka;kb;pv1;pv2                        
  1  1  1  74.0317  32.2712   0.9501   0.0000   0.1780  10.5736   1.0400        
  1  1  2  70.6558  14.3658   5.3224   0.0000   0.0058   0.0000   1.0400        
  2  1  2  76.7339  14.4217   3.3631   0.0000   0.0127   0.0000   1.0400        
  1  2  2   0.0000   0.0000   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  1  2  1   0.0000   3.4110   7.7350   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  2  2  2   0.0000  27.9213   5.8635   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  1  1  3  65.3104   6.3897   7.5000   0.0000   0.2000  10.0000   1.8525        
  3  1  3  71.9855  28.5708   6.4252   0.0000   0.2000   0.0000   1.8525        
  1  1  4  65.8892  45.0000   1.6598   0.0000   0.2000  10.0000   1.8525        
  3  1  4  73.1057  25.8227   4.2145   0.0000   0.2000   0.0000   1.8525        
  4  1  4  65.8759  40.9838   2.4369   0.0000   0.2000   0.0000   1.8525        
  2  1  3  56.3039  17.3681   5.3095   0.0000   0.9110   0.0000   1.0400        
  2  1  4  71.5505  11.1820   3.7129   0.0000   0.9110   0.0000   1.0400        
  1  2  4   0.0000   0.0019   6.3000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  1  3  1  72.3642  37.8942   1.1566   0.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  1  3  3  90.0000  45.0000   0.5719   0.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  1  3  4  70.4313  14.4055   7.1593   0.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  3  3  3  83.8833  23.3345   2.3433 -10.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  3  3  4  84.0407  45.0000   1.0695   0.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  4  3  4  73.9966  24.4410   5.2760   0.0000   0.7472   0.0000   1.2639        
  1  3  2  89.1394  37.0874   0.3849   0.0000   3.0000   0.0000   1.2618        
  2  3  3  80.7068   5.0854   5.7151   0.0000   3.0000   0.0000   1.2618        
  2  3  4  76.0238  45.0000   0.8637   0.0000   3.0000   0.0000   1.2618        
  2  3  2  82.3474  13.5165   3.4896   0.0000   0.3596   0.0000   1.3307        
  1  4  1  68.4330  19.3525   2.1625   0.0000   1.7325   0.0000   1.0440        
  1  4  3  86.2893  37.5587   1.2660   0.0000   1.7325   0.0000   1.0440        
  1  4  4  74.2404  12.0547   7.5000   0.0000   1.7325   0.0000   1.0440        
  3  4  3  78.5566  43.8492   1.3351 -26.1471   1.7325  40.0000   1.0440        
  3  4  4  77.4239  33.7297   1.7944  -0.9193   1.7325   0.0000   1.0440        
  4  4  4  64.9107  17.5558   7.5000   0.0000   1.7325   0.0000   1.0440        
  1  4  2  90.0000  32.0540   0.7195   0.0000   0.5355   0.0000   2.5279        
  2  4  3  84.1185  45.0000   1.3826   0.0000   0.5355   0.0000   2.5279        
  2  4  4  78.7133  24.6250   3.8202   0.0000   0.5355   0.0000   2.5279        
  2  4  2  56.3036  14.1532   3.3914   0.0000   0.2000   0.0000   2.1689        
  1  2  3   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  1  2  4   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  1  2  5   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  3  2  3   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  3  2  4   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  4  2  4   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  2  2  3   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
  2  2  4   0.0000   0.0019   6.0000   0.0000   0.0000   0.0000   1.0400        
17    ! Nr of torsions;at1;at2;at3;at4;;V1;V2;V3;V2(BO);vconj;n.u;n            
  1  1  1  1   0.0000  48.4194   0.3163  -8.6506  -1.7255   0.0000   0.0000     
  1  1  1  2   0.0000  63.3484   0.2210  -8.8401  -1.8081   0.0000   0.0000     
  2  1  1  2   0.0000  45.2741   0.4171  -6.9800  -1.2359   0.0000   0.0000     
  0  1  2  0   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000     
  0  2  2  0   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000   0.0000     
  0  1  3  0  -0.0002  85.8794   0.3236  -3.8134  -2.0000   0.0000   0.0000     
  0  2  3  0   0.0000   0.1000   0.0200  -2.5415   0.0000   0.0000   0.0000     
  0  3  3  0  -0.9667 116.4743   0.0002  -4.9422   0.0000   0.0000   0.0000     
  0  1  4  0  -0.0069 150.0000   0.4891  -7.4921  -2.0000   0.0000   0.0000     
  0  2  4  0   0.0000   0.1000   0.0200  -2.5415   0.0000   0.0000   0.0000     
  0  3  4  0   1.6745  56.6301  -0.0008  -4.5064  -2.0000   0.0000   0.0000     
  0  4  4  0   1.1253  75.3447   0.0080  -9.0000  -2.0000   0.0000   0.0000     
  0  1  1  0   0.0930  18.5962   0.0002  -9.0000  -1.0000   0.0000   0.0000     
  4  1  4  4  -2.0000  20.8732  -1.5000  -9.0000  -2.0000   0.0000   0.0000     
  1  1  3  3  -0.0002  21.5452   0.1727  -9.0000  -2.0000   0.0000   0.0000     
  1  3  3  1   0.0002  79.3777  -1.5000  -5.2139  -2.0000   0.0000   0.0000     
  3  1  3  3  -1.3476  22.4932   1.5000  -9.0000  -2.0000   0.0000   0.0000     
  4    ! Nr of hydrogen bonds;at1;at2;at3;Rhb;Dehb;vhb1                        
  3  2  3   2.0000  -5.0000   3.0000   3.0000                                   
  3  2  4   1.7753  -5.0000   3.0000   3.0000                                   
  4  2  3   1.3884  -5.0000   3.0000   3.0000                                   
  4  2  4   1.6953  -4.0695   3.0000   3.0000

6万

帖子

99

威望

6万

eV
积分
125148

管理员

公社社长

2#
发表于 Post on 2021-2-19 07:08:39 | 只看该作者 Only view this author
如置顶的新社员必读贴和论坛首页的公告栏所示,求助帖必须在帖子标题明确体现出此帖内容是求助或提问,仔细看http://bbs.keinsci.com/thread-9348-1-1.html。我已把你的不恰当标题“分子力场参数的意思”改了,以后务必注意

求助时候认真撰写帖子内容是得到有效回复的前提。直接把文件往这里一贴,什么说明都没有,也太省事了,毫无诚意。仔细看此文,好好修改帖子内容:
在网上求助计算化学问题时的注意事项
http://sobereva.com/79http://bbs.keinsci.com/thread-57-1-1.html

以后再以这么漫不经心的方式在本论坛发帖就直接删帖处理,本论坛不是那么随便的地方。
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
欢迎加入北京科音微信公众号获取北京科音培训的最新消息,并避免错过网上有价值的计算化学文章!
欢迎加入人气极高、专业性特别强的理论与计算化学综合交流群思想家公社QQ群(群号见此链接),合计达一万多人。北京科音培训班的学员在群中可申请VIP头衔,提问将得到群主Sobereva的最优先解答。
思想家公社的门口Blog:http://sobereva.com(发布大量原创计算化学相关博文)
Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
Google Scholar:https://scholar.google.com/citations?user=tiKE0qkAAAAJ
ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

手机版 Mobile version|北京科音自然科学研究中心 Beijing Kein Research Center for Natural Sciences|京公网安备 11010502035419号|计算化学公社 — 北京科音旗下高水平计算化学交流论坛 ( 京ICP备14038949号-1 )|网站地图

GMT+8, 2026-2-23 00:09 , Processed in 0.177886 second(s), 27 queries , Gzip On.

快速回复 返回顶部 返回列表 Return to list