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[Material Studio] 求助算rdf判断两个分子的混合能力

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楼主
请问各位老师:如果用算两个分子的径向分布函数来判断它们的混合能力,盒子中应该分别放这两个分子多少个啊?谢谢大家

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发表于 Post on 2022-2-28 13:49:01 | 只看该作者 Only view this author
xxzj 发表于 2022-2-27 16:48
老师,想请问您,判断混合能力可以通过计算平均每个A类分子附件B类数目,想向老师请教一下,这个功能如何 ...

自己写个VMD tcl脚本,循环每个A分子,利用within选择语句计算每个A分子附近B的数目,然后取平均

选择语句看
VMD里原子选择语句的语法和例子
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北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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发表于 Post on 2022-2-27 16:48:59 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-26 19:22
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A ...

老师,想请问您,判断混合能力可以通过计算平均每个A类分子附件B类数目,想向老师请教一下,这个功能如何实现?

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-26 19:50:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-26 19:22
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A ...

老师 我想考察的事 磷脂包裹药物分子的能力  

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发表于 Post on 2021-3-26 19:22:07 | 只看该作者 Only view this author
分子什么特征都不说,谁也没法告诉你至少放多少合适

判断混合能力有的是其它更好的做法,诸如平均每个A类分子附近B类数目
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-26 18:54:05 | 只看该作者 Only view this author
您好 请问怎么看密度啊 用哪个板块啊

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发表于 Post on 2021-3-26 17:06:54 | 只看该作者 Only view this author
正常人研究混合能力都直接看密度……

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