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[综合交流] 反应复合物优化后结果变成产物

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各位老师好,本人在优化反应复合物时(IRC跑完后,取反应物端),总是出现优化后直接得到产物,是不是意味着没有中间复合物?虽然在群里咨询了卢老师,但还是没有弄明白,到底如何确定复合物的存在,在论坛里搜了半天也没有找到答案,先谢谢各位了!

优化产物.png (67.89 KB, 下载次数 Times of downloads: 51)

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反应复合物.png (65.46 KB, 下载次数 Times of downloads: 44)

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发表于 Post on 2025-6-11 20:53:19 | 只看该作者 Only view this author
哈喽您好,对于您提问的过渡态跑IRC时出现非常规曲线这个博文,我也遇到类似情况;就是我在按照文献完全重复计算一个反应过渡态,文献中也给出两步基元反应(即存在TS1和TS2),存在一个中间体。但我计算时TS1找到和文献一样,跑IRC时,也会出现略平,最后就会直接到产物。我怎么也找不到和文献一样的中间体结构。第一步基元反应过程会涉及分子内电子结构转移过程,第二步反应很快。我想请问您对于你提的那个问题有解决吗?谢谢解答。

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-30 07:43:48 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-29 18:03
不在同一级别怎么对比
内行审稿人不comment就怪了

多谢,卢老师耐心解释!

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发表于 Post on 2021-3-29 18:03:55 | 只看该作者 Only view this author
clark_yang 发表于 2021-3-29 12:01
跑IRC和过渡态是同一级别进行的,反应复合物和产物复合物同样也要在一个级别么?这个问题还真没注意,非 ...

不在同一级别怎么对比
内行审稿人不comment就怪了
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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Multiwfn主页:http://sobereva.com/multiwfn(十分强大、极为流行的量子化学波函数分析程序)
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ResearchGate:https://www.researchgate.net/profile/Tian_Lu

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-29 12:01:29 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-28 23:01
跑IRC和优化过渡态要用同一级别这是基本常识。如果优化过渡态和优化极小点都不在一个级别,就属于低级错 ...

跑IRC和过渡态是同一级别进行的,反应复合物和产物复合物同样也要在一个级别么?这个问题还真没注意,非常抱歉。

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发表于 Post on 2021-3-28 23:01:49 | 只看该作者 Only view this author
clark_yang 发表于 2021-3-28 16:28
好的。卢老师,减少步长没有用,后面发现您回复别人一个帖子说用相同方法优化,所以我采用了和irc相同的 ...

跑IRC和优化过渡态要用同一级别这是基本常识。如果优化过渡态和优化极小点都不在一个级别,就属于低级错误了,完全发不了文章
北京科音自然科学研究中心http://www.keinsci.com)致力于计算化学的发展和传播,长期开办极高质量的各种计算化学类培训:初级量子化学培训班中级量子化学培训班高级量子化学培训班量子化学波函数分析与Multiwfn程序培训班分子动力学与GROMACS培训班CP2K第一性原理计算培训班,内容介绍以及往届资料购买请点击相应链接查看。这些培训是计算化学从零快速入门以及进一步全面系统性提升研究水平的高速路!培训各种常见问题见《北京科音办的培训班FAQ》
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-28 16:28:04 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-28 10:36
产物如果是单分子当然没有复合物

好的。卢老师,减少步长没有用,后面发现您回复别人一个帖子说用相同方法优化,所以我采用了和irc相同的方法优化,结果可以了,谢谢您!irc用的是b3lyp,复合物用M062x不行,总是优化到产物了,继续用b3lyp就可以了,写出来是希望别人出现同类型问题时好解决,最后感谢上面所有回复的老师!,

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发表于 Post on 2021-3-28 10:36:30 | 只看该作者 Only view this author
clark_yang 发表于 2021-3-27 12:32
嗯,确实请教过您,正在减小步长尝试,同时,另外有个问题,若是加成反应,产物方向应该是没有复合物?还 ...

产物如果是单分子当然没有复合物
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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-27 12:48:47 | 只看该作者 Only view this author
wzkchem5 发表于 2021-3-26 18:29
不过也不排除这个反应有两条途径,一条没有势垒的,一条有势垒的,你的IRC对应的是后者,优化反应复合物时 ...

多谢,正在尝试!

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 楼主 Author| 发表于 Post on 2021-3-27 12:32:16 | 只看该作者 Only view this author
sobereva 发表于 2021-3-26 19:26
我不记得你有问过我

减小步长上限

嗯,确实请教过您,正在减小步长尝试,同时,另外有个问题,若是加成反应,产物方向应该是没有复合物?还是仍有复合物?按照逻辑,最终产物应该是势能面最低点,不知道理解的对不对?

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发表于 Post on 2021-3-26 19:26:20 | 只看该作者 Only view this author
我不记得你有问过我

减小步长上限
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发表于 Post on 2021-3-26 18:29:38 | 只看该作者 Only view this author
不过也不排除这个反应有两条途径,一条没有势垒的,一条有势垒的,你的IRC对应的是后者,优化反应复合物时沿着前者变成了产物。总之先试试减小优化步长再看
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
Google Scholar: https://scholar.google.com/citations?hl=zh-CN&user=XW6C6eQAAAAJ&view_op=list_works&sortby=pubdate
ORCID: https://orcid.org/0000-0002-4540-8734
主页:http://www.qitcs.qd.sdu.edu.cn/info/1034/1702.htm
本团队长期招收研究生,有意者可私信联系

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发表于 Post on 2021-3-26 18:27:55 | 只看该作者 Only view this author
IRC有一个峰,说明这个反应还是有势垒的,优化得到产物可能是因为优化步长太大,步子迈太大直接跨过势垒了。可以减小优化步长试试
Zikuan Wang
山东大学光学高等研究中心 研究员
BDF(https://bdf-manual.readthedocs.io/zh_CN/latest/Introduction.html)、ORCA(https://orcaforum.kofo.mpg.de/index.php)开发团队成员
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